66 Whole-Body Biogeography of the Bacterial Microbiota in Newborn Calves and Response of These Communities to Prenatal Vitamin and Mineral Supplementation
Notice bibliographique
Résumé
Abstract During gestation, alterations in maternal nutrition during fetal development may alter growth trajectory and metabolic function in the developing fetus. Additionally, there is increasing evidence that the fetal microbiome also influences developmental outcomes. Research in this area is limited, and gastrointestinal microbiota has been the primary focus in cattle. Our objective was to assess the whole-body biogeography of the newborn calf microbiota and the response of these microbial communities and the calf immune system to prenatal vitamin and mineral (VTM) supplementation. Samples were collected from the hoof, liver, lung, nasal cavity, eye, rumen (tissue and fluid), and vagina of female beef calves that were born from dams that received either prenatal VTM or no VTM (Control; n = 7/group) throughout gestation. Calves were separated from their dams immediately after birth and fed colostrum replacement until euthanasia at 30 h post-initial colostrum feeding. The microbiota from swab and tissue samples were assessed using 16S rRNA gene sequencing (V4) and qPCR. Serum samples were processed for multiplex quantification of 15 cytokines and chemokines. Sequencing revealed the presence of a relatively diverse and complex microbiota in each of the 7 anatomical locations. The community structure of the hoof, liver, ocular, and vaginal microbiota were significantly different from the ruminal microbiota (0.64 ≥ R2 ≥ 0.12, P ≤ 0.003). The respiratory (nasal and lung) had similar community structures to that of ocular, vaginal, and ruminal fluid microbiota (P > 0.11). The ocular, hoof, and vagina had the greatest microbial richness (observed ASVs; P < 0.05) but similar diversity (Shannon; P > 0.05) compared with other samples. The liver and ruminal fluid had the least microbially rich communities, the latter also being the least diverse (P < 0.05). Firmicutes, Actinobacteriota, and Proteobacteria were the dominant phyla across all sample types, but their abundance varied by location. The ruminal fluid and hoof had the greatest bacterial concentration, while the liver, lung and ruminal tissue had reduced bacterial abundance as estimated by qPCR. An influence of VTM supplementation on microbial community structure was only detected in the ruminal fluid microbiota (P < 0.01). While prenatal VTM supplementation did not affect the nasal, lung, liver, and hoof microbiota, differences (P < 0.05) were detected in microbial richness (vagina), diversity (ruminal tissue and fluid, ocular), composition at the phylum level (ruminal tissue, ocular, and vagina), and total bacterial abundance (ocular and vagina). Among the 15 cytokines evaluated, the concentration of IP-10 was increased (P = 0.02) while IL-4 and IL-17A were reduced (P < 0.05)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».