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Enregistrement W4388207393 · doi:10.26685/urncst.528

Can TGF-β Differentiate Fibroblasts and Endothelial Cells into CAFs?: A Research Protocol

2023· article· en· W4388207393 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevueUndergraduate Research in Natural and Clinical Science and Technology (URNCST) Journal · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransforming growth factorCancer-Associated FibroblastsCell cultureCancer researchMetastasisSecretionCell migrationCancer cellCell biologyCell growthChemistryCellBiologyTumor microenvironmentCancerInternal medicineEndocrinologyMedicineTumor cellsBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is one of the most lethal forms of cancer in Canada. Tumour metastasis contributes to most of the deaths, a process heavily influenced by cancer-associated fibroblasts (CAFs). While the functions of CAFs have been widely researched, such as their metastasis-promoting secretion of growth factors, their origins remain unclear. This research protocol, therefore, seeks to confirm that PDAC cells are capable of differentiating both fibroblasts and endothelial cells into CAFs by secreting transforming growth-factor beta (TGF-β). Methods: The effects of culturing Hs68 fibroblasts and HMEC-1 endothelial cells in media containing TGF-β will be examined using media supplemented with TGF-β and conditioned media obtained from PANC-1 cells. To confirm these results, TGF-β receptor-inhibited cells will be included also. Proliferation assays, migration assays, RT-qPCR, and western blotting will then be used to determine successful differentiation into CAFs. Results: It is expected that the presence of TGF-β in culture media will lead to the increased proliferation, migration, and presence of CAF cell markers within the cell culture. The inhibited conditions grown in standard media with the added factor are expected to be comparable to their control groups. The same is expected of the inhibited HMEC-1 cells grown in PANC-1 conditioned media, however the Hs68 culture should more closely resemble its uninhibited condition. Discussion: The increased results described above for the uninhibited conditions grown in TGF-β-containing media would indicate the following; that this factor is capable of differentiating Hs68 and HMEC-1 cells into CAFs, and that PANC-1 cells are capable of initiating this change. This would be confirmed by the lack of difference between the inhibited versus control conditions; showing that this secreted factor is indeed responsible for these effects. Conclusion: The results from this protocol will help to solidify fibroblasts and endothelial cells as origins of CAFs, and TGF-β as a CAF-generating factor. By knowing more about their origin, the development of new potential drugs that target the formation of TGF-β is possible. Further directions could include the possibility of in vivo experiments confirming the results of this protocol.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,104

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0310,017

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,497
Écart entre enseignants0,391 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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