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Enregistrement W4388221906 · doi:10.1111/jvim.16925

Association of the <i>FGF4L2</i> retrogene with fibrocartilaginous embolic myelopathy in dogs

2023· article· en· W4388221906 sur OpenAlexaboutno aff
Colleen Embersics, Danika L. Bannasch, Kevin Batcher, C. Elizabeth Boudreau, Molly E. Church, Andrew D. Miller, Simon R. Platt, Jennifer W. Koehler, Natasha J. Olby, John H. Rossmeisl, Daniel R. Rissi, Robert A. Grahn, Jonas Donner, Peter J. Dickinson

Notice bibliographique

RevueJournal of Veterinary Internal Medicine · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueVeterinary Orthopedics and Neurology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCenter for Companion Animal Health, University of California, DavisSchool of Veterinary Medicine, University of California, Davis
Mots-clésMedicineBreedGenotypePopulationAllelePathologyMyelopathyPathogenesisGeneticsSpinal cordBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Fibrocartilaginous embolic myelopathy (FCE) is a well-documented condition in dogs although rarely reported in chondrodystrophic breeds. Genetic associations have not been defined. OBJECTIVES: Define the association of the chondrodystrophy-associated FGF4L2 retrogene with histopathologically confirmed cases of FCE. ANIMALS: Ninety-eight dogs with a histopathologic diagnosis of FCE. METHODS: Retrospective multicenter study. Dogs were genotyped for the FGF4L2 and FGF4L1 retrogenes using DNA extracted from formalin-fixed, paraffin-embedded tissue. Associations between breed, FCE and retrogene status were investigated with reference to a hospital population and known breed and general population allele frequencies. RESULTS: FGF4L2 genotype was defined in 89 FCE cases. Fibrocartilaginous embolic myelopathy was present in 22 dogs from FGF4L2-segregating breeds with allele frequencies of ≥5%; however, all dogs were wild type. Two Labrador retrievers with FCE carried FGF4L2 alleles. Frequency of the FGF4L2 allele was significantly (P < .001) and negatively associated with FCE relative to predicted hospital-population dogs. FCE was overrepresented in Boxer, Great Dane, Yorkshire Terrier, Bernese Mountain Dog, Miniature Schnauzer, Rottweiler, and Shetland Sheepdog breeds. CONCLUSIONS AND CLINICAL IMPORTANCE: Study data based on genotypically and histopathologically defined cases support the historical observation that FCE is uncommon in chondrodystrophic dog breeds. FGF4 plays an important role in angiogenesis and vascular integrity; anatomical studies comparing chondrodystrophic and non-chondrodystrophic dogs might provide insight into the pathogenesis of FCE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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