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Enregistrement W4388302233 · doi:10.1002/cjp2.347

Engineering the future of <scp>3D</scp> pathology

2023· article· en· W4388302233 sur OpenAlex
Jonathan Liu, Sarah S. L. Chow, Richard Colling, Michelle R. Downes, Xavier Farré, Peter A. Humphrey, Andrew Janowczyk, Tuomas Mirtti, Clare Verrill, Inti Zlobec, Lawrence D. True

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology Clinical Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAI in cancer detection
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteNIHR Oxford Biomedical Research CentreSchweizerische Akademie der Medizinischen WissenschaftenUniversity of OxfordNational Institute for Health and Care ResearchUK Research and InnovationU.S. Department of DefensePancreatic Cancer UKUniversity of BernDOD Prostate Cancer Research ProgramDepartment of Health and Social CareNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanary FoundationDivision of Cancer Prevention, National Cancer InstituteProstate Cancer UKNational Science Foundation
Mots-clésComputer scienceDigital pathologyPathologyHigh resolutionVisualizationPerspective (graphical)Artificial intelligenceMedicineGeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In recent years, technological advances in tissue preparation, high-throughput volumetric microscopy, and computational infrastructure have enabled rapid developments in nondestructive 3D pathology, in which high-resolution histologic datasets are obtained from thick tissue specimens, such as whole biopsies, without the need for physical sectioning onto glass slides. While 3D pathology generates massive datasets that are attractive for automated computational analysis, there is also a desire to use 3D pathology to improve the visual assessment of tissue histology. In this perspective, we discuss and provide examples of potential advantages of 3D pathology for the visual assessment of clinical specimens and the challenges of dealing with large 3D datasets (of individual or multiple specimens) that pathologists have not been trained to interpret. We discuss the need for artificial intelligence triaging algorithms and explainable analysis methods to assist pathologists or other domain experts in the interpretation of these novel, often complex, large datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,035
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,669
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0350,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,133
Tête enseignante GPT0,451
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle