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Enregistrement W4388328273 · doi:10.36838/v5i5.25

Improved Ethanol Tolerance and Production in Pyruvate Dehydrogenase Mutant of Saccharomyces cerevisiae

2023· article· en· W4388328273 sur OpenAlexaff
Anna Yang

Notice bibliographique

RevueInternational journal of high school research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensMilton District Hospital
Organismes subventionnairesLawrence Livermore National LaboratoryArmy Research OfficeNational Institute of General Medical SciencesNational Institute for Health and Care ResearchU.S. Department of DefenseGordon and Betty Moore FoundationU.S. Department of EnergyWashington University in St. LouisNational Science Foundation
Mots-clésSaccharomyces cerevisiaeChemistryPyruvate dehydrogenase complexEthanolEthanol fuelAlcohol dehydrogenaseMutantPyruvate dehydrogenase phosphataseBiochemistryYeastEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ethanol, a naturally synthesized compound by Saccharomyces cerevisiae yeast through alcoholic fermentation, has previously been studied as a renewable alternative to traditional fossil fuels.However, current challenges of engineering S. cerevisiae strains for ethanol production remain and include: ethanol productivity, inefficient substrate catabolism, and a buildup of toxic products to inhibitory levels.In this study, we proposed a method of metabolic rewiring via the deletion of the pda1 gene, which leads to pyruvate dehydrogenase (PDH) deficiency.The pda1 mutant strain was created by CRISPR Cas-9 knockout using the constructed pCRCT-PDA1 plasmid.Subsequently, mutant candidates were screened by PCR and Sanger sequencing, confirming a 17 bp deletion in the pda1 gene.The wild-type and mutant strains were analyzed for growth under aerobic and anaerobic conditions in glucose and glycerol, as well as ethanol production and tolerance.The pda1 mutant displays a ~two-fold increase in anaerobic ethanol production and an aerobic growth defect with no observed increase in ethanol production.The mutant is also hyper-tolerant to ethanol, which allows a faster buildup of products in growth media with minimal reduction in growth.This new S. cerevisiae strain deficient in PDH may provide a solution to the efficient and abundant synthesis of biofuels such as ethanol by redirecting metabolic flux and altering stress response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,227

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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