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Enregistrement W4388376909 · doi:10.1101/2023.11.04.23298104

Unsupervised subgrouping of chronic low back pain patients treated in a specialty clinic

2023· preprint· en· W4388376909 sur OpenAlexaff
Abel Torres‐Espín, Anastasia Keller, Susan K. Ewing, Andrew Bishara, Naoki Takegami, Adam R. Ferguson, Trisha F. Hue, Jeff Lotz, Thomas A. Peterson, Patricia Zheng, Conor O’Neill

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMusculoskeletal pain and rehabilitation
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésMedicineSpecialtyChronic painPopulationMedical prescriptionLow back painPhysical therapyAlternative medicineFamily medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Chronic low back pain (cLBP) is the leading cause of disability worldwide. Current treatments have minor or moderate effects, partly because of the idiopathic nature of most cLBP cases, the complexity of its presentation, and heterogeneity in the population. Explaining this complexity and heterogeneity by identifying subgroups of patients is critical for personalized health. Clinical decisions tailoring treatment to patients’ subgroup characteristics and specific treatment responses can improve health outcomes. Current patient stratification tools divide cases into subgroups based on a small subset of characteristics, which may not capture many factors determining patient phenotypes. Methods and Findings In this study, we use an unsupervised machine learning framework to identify patient subgroups within a specialized back pain clinic and evaluate their outcomes. Our analysis identified 25 latent factors determining patient phenotypes and found three distinctive clusters of patients. The research suggests that there is heterogeneity in the population of patients treated in a specialty setting and that several factors determine patient phenotypes. Cluster 1 consists of those individuals with characteristics found to be protective of chronic pain: younger age, low pain medication prescription, high function, good insurance access, and low overlapping pain conditions. Individuals in Cluster 3 associate with older age and present with a higher incidence of chronic overlapping pain conditions, comorbidities, and pain medication use. Cluster 2 is an intermediate group. Conclusions We quantify cLBP population heterogeneity and demonstrate how ML analytical workflow can be used to explain, in part, this heterogeneity in relation to outcomes. Notably, considering a data-driven approach from multi-domain data produces different subgroups than the STarT back screening tool, and the addition of other functional metrics at baseline such as global physical and mental function, and pain intensity, increases the variance explained in outcomes. Our study provides novel insights into the complex nature of cLBP and the potential for data-driven methods to identify clinically relevant subtypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,010
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,010
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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