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Enregistrement W4388377314 · doi:10.1101/2023.11.04.23298088

Drug target Mendelian randomization supports apolipoprotein C3-lowering for lipoprotein-lipid levels reductions and cardiovascular diseases prevention

2023· preprint· en· W4388377314 sur OpenAlexafffund
Éloi Gagnon, Benoît J. Arsenault

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipid metabolism and disorders
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - Santé
Mots-clésMendelian randomizationMedicineInternal medicineOdds ratioApolipoprotein BSingle-nucleotide polymorphismGenome-wide association studyEndocrinologyCholesterolBioinformaticsGeneticsBiologyGeneGenotypeGenetic variants

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background and aims Inhibitors of apolipoprotein C-III (apoC3) are currently approved for the reduction of triglyceride levels in patients with Familial Chylomicronemia Syndrome. We used drug target Mendelian randomization (MR) to assess the effect of genetically predicted decrease in APOC3 blood protein levels on cardiometabolic traits and diseases. Methods We quantified lifelong reductions in APOC3 blood levels by selecting all genome wide significant and independent ( r 2 <0.1) single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the APOC3 gene region ±1Mb, from three genome-wide association studies (GWAS) of apoC3 blood protein levels (deCODE, n = 35,378, Fenland, n = 10,708 and ARIC, n = 7,213). We included the largest GWASes on 18 cardiometabolica traits and 9 cardiometabolic diseases as study outcomes. Results A one standard deviation lowering in apoC3 blood protein levels was associated with lower triglycerides, apolipoprotein B, density lipoprotein cholesterol, alanine aminotransferase, and glomerular filtration rate as well as higher high-density lipoprotein cholesterol levels. APOC3 lowering was also associated with lower risk of acute pancreatitis (odds ratio [OR] = 0.91 95% CI=0.82 to 1.00), aortic stenosis (OR = 0.82 95% CI=0.73 to 0.93), and coronary artery disease (OR = 0.86 95% CI=0.80 to 0.93), and was associated with increased parental lifespan (0.06 95% CI=0.03 to 0.09 years). These results were concordant across robust MR methods, the three protein datasets and upon adjustment for APOA1, APOA4 and APOA5 using a multivariable MR framework. Conclusions These results provide evidence that apoC3 lowering could result in widespread benefits for cardiometabolic health and encourage the launch of trials on apoC3 inhibition for coronary artery disease prevention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,021
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,045
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,113

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0210,045
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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