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Enregistrement W4388384715 · doi:10.1093/oso/9780199637584.003.0001

An introduction to differential display and related techniques

2000· book-chapter· en· W4388384715 sur OpenAlexaff
H.A. Robertson, Ronald A Lesliet

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typebook-chapter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene Regulatory Network Analysis
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSkepticismSimplicityDifferential (mechanical device)Computer scienceData scienceCognitive scienceEpistemologyPsychologyEngineeringPhilosophy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract It is worth acknowledging, as there is no way around it, that differential display has been, and remains, a controversial technique. Any technique that engenders articles with the word ‘dismay ‘ in the title (1) must be controversial! More than a thousand articles, however, have now been published describing results achieved with the use of the differential display technique and hundreds of genes have been ‘discovered ‘. This book has been written with the firm belief that much of the scepticism that differential display has engendered is based upon a frequent poor understanding of the technique and the premature publication of many studies. Such studies have often been undertaken by groups who were early to recognize the power of this technique in biological applications but who had not yet achieved the necessary technical expertise to apply the technique successfully. Thus, in the heady days after the introduction of the technique by Liang and Pardee in 1992 (2), many biologists with divergent areas of expertise (neurobiology, psychology, plant sciences, pharmacology) rushed into applying the technique in their particular systems without, perhaps, a sufficiently solid background in modern molecular biology. This was a testi monial to the apparent simplicity of the technique and to the potential breadth of biological systems to which the technique might be applied.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,108

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0320,020

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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