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Enregistrement W4388384903 · doi:10.1101/2023.11.02.565360

FABP7 Progenitors are a Targetable Metabolic Root in the <i>BRCA1</i> Breast

2023· preprint· en· W4388384903 sur OpenAlexafffund
Curtis W. McCloskey, Bowen Zhang, Matthew Waas, Golnaz Abazari, Foram Vyas, Kazeera Aliar, Pirashaanthy Tharmapalan, Abhijith Kuttanamkuzhi, Swami Narala, Jennifer Cruikshank, Stefan O.P. Hofer, Hartland W. Jackson, Thomas Kislinger, Hal K. Berman, Rama Khokha

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésProgenitor cellBreast cancerCancer researchPopulationBiologyClonogenic assayCell biologyCancerCellStem cellMedicineBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract It has been nearly 3 decades since the discovery of the BRCA1/2 genes and their link to breast cancer risk, with prophylactic mastectomy remaining the primary management option for these high-risk mutation carriers. The current paucity of interception strategies is due to undefined, targetable cancer precursor populations in the high-risk breast. Despite known cellular alterations in the BRCA1 breast, epithelial populations at the root of unwarranted cell state transitions remain unresolved. Here, we identify a root progenitor population that is dysregulated in BRCA1 carriers stemming from the metabolic role of BRCA1. This fatty-acid binding protein 7 (FABP7) expressing luminal progenitor population is spatially confined to the mammary ducts, has enhanced clonogenic capacity, and is the predicted origin of mixed basal-luminal differentiation in the BRCA1 but not BRCA2 breast. We show global H3K27 acetylation is reduced within ductal FABP7 cells in BRCA1 carriers in situ , linking to a non-canonical metabolic role of BRCA1 in regulating acetyl-CoA pools and de novo fatty acid synthesis. We demonstrate FABP7 progenitor capacity is preferentially ablated in BRCA1 carriers through inhibition of fatty acid metabolism using an FDA-approved fatty acid synthase (FASN) inhibitor. This study lays the foundation for metabolic control of breast progenitor dynamics to mitigate breast cancer risk in the BRCA1 breast.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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