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Enregistrement W4388409837 · doi:10.1101/2023.11.06.565750

Spatial conservation planning of forest genetic resources in a Mediterranean multi-refugial area

2023· preprint· en· W4388409837 sur OpenAlexaboutno aff
Elia Vajana, Marco Andrello, Camilla Avanzi, Francesca Bagnoli, Giovanni G. Vendramin, Andrea Piotti

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest Management and Policy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIntraspecific competitionGeographyGenetic diversityDistribution (mathematics)Spatial distributionDiversity (politics)EcologyTree (set theory)AgroforestryForestryBiologyRemote sensingMathematicsPopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Kunming-Montreal Global Biodiversity Framework recognised the urgency of taking action to conserve intraspecific genetic diversity (IGD) as an insurance against habitat degradation and environmental change. Recent work suggests that 90-99% of IGD should be conserved to safeguard viability of future generations. Here, we addressed such a conservation issue in three forest tree species in Italy: silver fir ( Abies alba Mill.), Heldreich’s pine ( Pinus heldreichii H. Christ), and pedunculate oak ( Quercus robur L.). We used microsatellite markers to measure IGD of 36 ( A. alba ), 15 ( P. heldreichii ) and 25 ( Q. robur ) natural sites, including several putative glacial refugia. We developed a spatial conservation planning (SCP) analysis to quantify the genetic irreplaceability of each site and identify the minimum set coverage ensuring IGD protection. Finally, we compared SCP results with the contributions to allelic diversity within and between sites, total allelic diversity and private allelic richness. We found that between 44% and 73% of sites were required to conserve 90-99% of the alleles, and that this conservation effort held even when targeting lower percentages of alleles to protect (50-75%). Glacial refugia were often included in the minimum set coverage, confirming theoretical and biogeographical expectations. Finally, sites with high genetic irreplaceability were found to have higher private allelic richness on average. These results are discussed in the light of the biogeographic history of the species studied and the current policies for the conservation of forest genetic resources.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,053

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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