A novel pathway of levodopa metabolism by commensal Bifidobacteria
Notice bibliographique
Résumé
The gold-standard treatment for Parkinson's disease is levodopa (L-DOPA), which is taken orally and absorbed intestinally. L-DOPA must reach the brain intact to exert its clinical effect; peripheral metabolism by host and microbial enzymes is a clinical management issue. The gut microbiota is altered in PD, with one consistent and unexplained observation being an increase in Bifidobacterium abundance among patients. Recently, certain Bifidobacterium species were shown to have the ability to metabolize L-tyrosine, an L-DOPA structural analog. Using both clinical cohort data and in vitro experimentation, we investigated the potential for commensal Bifidobacteria to metabolize this drug. In PD patients, Bifidobacterium abundance was positively correlated with L-DOPA dose and negatively with serum tyrosine concentration. In vitro experiments revealed that certain species, including B. bifidum, B. breve, and B. longum, were able to metabolize this drug via deamination followed by reduction to the compound 3,4-dihydroxyphenyl lactic acid (DHPLA) using existing tyrosine-metabolising genes. DHPLA appears to be a waste product generated during regeneration of NAD +. This metabolism occurs at low levels in rich medium, but is significantly upregulated in nutrient-limited minimal medium. Discovery of this novel metabolism of L-DOPA to DHPLA by a common commensal may help inform medication management in PD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».