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Enregistrement W4388415814 · doi:10.3390/jmse11112115

On the Species Identification of Korean Geoduck Clam (Panopea sp. 1) Based on the Morphological and Molecular Evidence

2023· article· en· W4388415814 sur OpenAlexaff
Jeonghoon Han, Jong Guk Kim, O-Nam Kwon, Jordan Jun Chul Park, Kyun‐Woo Lee, Young‐Ung Choi

Notice bibliographique

RevueJournal of Marine Science and Engineering · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Invertebrate Ecology and Behavior
Établissements canadiensUniversité Sainte-Anne
Organismes subventionnairesKorea Institute of Marine Science and Technology promotionNational Marine Biodiversity Institute of KoreaKorea Institute of Ocean Science and TechnologyMinistry of Oceans and Fisheries
Mots-clésBiologyMitochondrial DNAFisheryPhylogenetic treeEcologyScallopZoologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The geoduck clam is a high-value species in South Korea. However, the molecular and morphological characteristics of geoduck clams from the southern coast of South Korea remain unexamined. The accurate identification of native geoduck clams is crucial for their conservation and management. Therefore, this study used a combination of molecular and morphological analyses to characterize native geoduck clams from the southern coast of South Korea. Based on complete mitochondrial genome and morphological analyses, the native species of geoduck clam from this study area was identified as Panopea sp. 1. The complete mitochondrial genome sequencing of Panopea sp. 1 revealed a total of 16,225 bp in length with 37 genes (13 protein-coding genes, 22 tRNA genes, and 2 rRNA genes). It was also shown that Panopea sp. 1 belongs to the family Hiatellidae based on a phylogenetic analysis tree with 11 bivalve species. In particular, Panopea sp. 1 is closely related to three other Panopea species (Panopea sp., Panopea abrupta, and Panopea japonica). The phylogenetic analysis correlated with the morphological analysis. Overall, this is the first reliable record of Panopea sp. 1 in South Korea. These findings provide a basis for accurate species identification based on morphological characteristics and complete mitochondrial genome sequencing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,868
Score d'incertitude au seuil0,322

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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