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Enregistrement W4388419594 · doi:10.1111/tra.12923

Peroxisome population control by phosphoinositide signaling at the <scp>endoplasmic reticulum‐plasma membrane</scp> interface

2023· article· en· W4388419594 sur OpenAlexafffund
Barbara Knoblach, Richard A. Rachubinski

Notice bibliographique

RevueTraffic · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPeroxisomeEndoplasmic reticulumCell biologyBiologyMembrane contact siteCell cortexPopulationLipid dropletCytosolOrganelleBiochemistryMembrane proteinCellReceptorIntegral membrane proteinMembraneEnzymeCytoskeleton

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphoinositides are lipid signaling molecules acting at the interface of membranes and the cytosol to regulate membrane trafficking, lipid transport and responses to extracellular stimuli. Peroxisomes are multicopy organelles that are highly responsive to changes in metabolic and environmental conditions. In yeast, peroxisomes are tethered to the cell cortex at defined focal structures containing the peroxisome inheritance protein, Inp1p. We investigated the potential impact of changes in cortical phosphoinositide levels on the peroxisome compartment of the yeast cell. Here we show that the phosphoinositide, phosphatidylinositol-4-phosphate (PI4P), found at the junction of the cortical endoplasmic reticulum and plasma membrane (cER-PM) acts to regulate the cell's peroxisome population. In cells lacking a cER-PM tether or the enzymatic activity of the lipid phosphatase Sac1p, cortical PI4P is elevated, peroxisome numbers and motility are increased, and peroxisomes are no longer firmly tethered to Inp1p-containing foci. Reattachment of the cER to the PM through an artificial ER-PM "staple" in cells lacking the cER-PM tether does not restore peroxisome populations to the wild-type condition, demonstrating that integrity of PI4P signaling at the cell cortex is required for peroxisome homeostasis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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