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Enregistrement W4388439682 · doi:10.1139/cjfas-2022-0279

Integrating disparate survey data in species distribution models demonstrate the need for robust model evaluation

2023· article· en· W4388439682 sur OpenAlexafffundvenue
Jessica Nephin, Patrick L. Thompson, Sean C. Anderson, Ashley E. Park, Christopher N. Rooper, Brendan Aulthouse, Joe Watson

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British ColumbiaFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesNatural Resources CanadaFisheries and Oceans CanadaNational Oceanic and Atmospheric AdministrationGovernment of Canada
Mots-clésSurvey data collectionSampling (signal processing)Computer scienceGeneralized linear mixed modelGeographyStatisticsData miningMachine learningMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marine spatial planning and conservation initiatives benefit from an understanding of species distributions across larger geographic areas than are often sampled by any one survey. Here, we test whether the integration of disparate survey data can improve habitat predictions across a region not well sampled by a single survey using Dungeness crab ( Metacarcinus magister) from British Columbia as a case study. We assemble data from dive, trawl, and baited-trap surveys to generate six candidate generalized linear mixed-effect models with spatial random fields. To compare single-survey and integrated models, we evaluate predictive performance with spatially buffered leave-one-out cross-validation and independently with two novel approaches using fisheries catch data. We find improved predictive performance and reduced uncertainty when integrating data from surveys that suffer from small sample size, low detectability, or limited spatial coverage. We demonstrate the importance of robust model evaluation when integrating data and predicting to unsampled locations. In addition, we highlight the need for careful consideration of sampling biases and model assumptions when integrating data to reduce the risk of prediction errors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,079
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,151
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,921
Score d'incertitude au seuil0,420

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0790,151
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,005
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,239
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,064 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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