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Enregistrement W4388447385 · doi:10.1093/gbe/evad198

Genetic Analysis of Mingrelians Reveals Long-Term Continuity of Populations in Western Georgia (Caucasus)

2023· article· en· W4388447385 sur OpenAlexfundno aff
Theodore G. Schurr, Ramaz Shengelia, Michel Shamoon‐Pour, David Chitanava, Shorena Laliashvili, Irma Laliashvili, Redate Kibret, Yanu Kume-Kangkolo, Irakli Akhvlediani, Lia Bitadze, Iain Mathieson, Aram Yardumian

Notice bibliographique

RevueGenome Biology and Evolution · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueForensic and Genetic Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Science Foundation of Sri LankaUniversity of PennsylvaniaUniversité de MontréalNational Science Foundation
Mots-clésHaplogroupBiologyHaplotypeMitochondrial DNAHuman mitochondrial DNA haplogroupGene poolGenetic diversityGeneticsAncient DNAPopulationEvolutionary biologySingle-nucleotide polymorphismSubcladePhylogenetic treeDemographyGenotypeGeneClade

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To elucidate the population history of the Caucasus, we conducted a survey of genetic diversity in Samegrelo (Mingrelia), western Georgia. We collected DNA samples and genealogical information from 485 individuals residing in 30 different locations, the vast majority of whom being Mingrelian speaking. From these DNA samples, we generated mitochondrial DNA (mtDNA) control region sequences for all 485 participants (female and male), Y-short tandem repeat haplotypes for the 372 male participants, and analyzed all samples at nearly 590,000 autosomal single nucleotide polymorphisms (SNPs) plus around 33,000 on the sex chromosomes, with 27,000 SNP removed for missingness, using the GenoChip 2.0+ microarray. The resulting data were compared with those from populations from Anatolia, the Caucasus, the Near East, and Europe. Overall, Mingrelians exhibited considerable mtDNA haplogroup diversity, having high frequencies of common West Eurasian haplogroups (H, HV, I, J, K, N1, R1, R2, T, U, and W. X2) and low frequencies of East Eurasian haplogroups (A, C, D, F, and G). From a Y-chromosome standpoint, Mingrelians possessed a variety of haplogroups, including E1b1b, G2a, I2, J1, J2, L, Q, R1a, and R1b. Analysis of autosomal SNP data further revealed that Mingrelians are genetically homogeneous and cluster with other modern-day South Caucasus populations. When compared with ancient DNA samples from Bronze Age archaeological contexts in the broader region, these data indicate that the Mingrelian gene pool began taking its current form at least by this period, probably in conjunction with the formation of a distinct linguistic community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,223
Score d'incertitude au seuil0,317

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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