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Enregistrement W4388487107 · doi:10.1101/2023.11.07.565956

Craniofacial studies in chicken embryos confirm the pathogenicity of Frizzled2 variants associated with Robinow syndrome

2023· preprint· en· W4388487107 sur OpenAlexafffund
Shruti S. Tophkhane, Katherine Fu, Esther M. Verheyen, Joy M. Richman

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCraniofacialPathogenicityEmbryoBiologyCraniofacial abnormalityAnatomyGeneticsMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Robinow syndrome (RS) is a rare disease caused by mutations in seven WNT pathway genes. Features include craniofacial widening and jaw hypoplasia. We used the chicken embryo to test two autosomal dominant RS (ADRS) missense FZD2 variants on the frontonasal mass, the affected region in RS. The wild-type (wt) and variant h FZD2 inhibited beak ossification. The bone hypoplasia was possibly mediated by decreased levels of WNT and BMP pathway genes. In primary cultures, h FZD2 variants inhibited chondrogenesis, increased nuclear shuttling of β-catenin and increased expression of TWIST1, both known to suppress chondrogenesis. In luciferase reporter assays, proteins coding for 1301G>T and 425C>T FZD2 variants weakly activated canonical WNT reporter and dominantly interfered with wt FZD2 . In the JNK-PCP WNT pathway luciferase assay, only the 425C>T showed a loss-of-function. The 1301G>T variant presumably acts through a JNK-independent pathway. This is the first study to demonstrate that the ADRS- FZD2 missense variants cause craniofacial and WNT signaling defects. Frontonasal mass width is increased by both h FZD2 variants which sheds light on the ontogeny of the broad facial features seen in individuals with RS. Summary Statement Gain-of-function studies on FZD2 missense variants associated with Robinow syndrome led to increased facial width, altered Wnt signaling and inhibition of beak skeletogenesis in chicken embryos.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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