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Enregistrement W4388513658 · doi:10.1101/2023.11.06.565917

Brain-Age Prediction: Systematic Evaluation of Site Effects, and Sample Age Range and Size

2023· preprint· en· W4388513658 sur OpenAlexafffund
Yuetong Yu, H. Cui, Shalaila S. Haas, Faye New, Nicole Sanford, Kevin Yu, Denghuang Zhan, Guoyuan Yang, Jia‐Hong Gao, Dongtao Wei, Jiang Qiu, Boris C. Bernhardt, Paul M. Thompson, Sophia Frangou, Ruiyang Ge

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesHelse Sør-Øst RHFNational Health and Medical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNIHR Maudsley Biomedical Research CentreAvid RadiopharmaceuticalsNational Institute of Mental HealthHorizon 2020 Framework ProgrammeNational Institutes of HealthMax Planck Instituut voor PsycholinguïstiekMedical Research CouncilHersenstichtingRadboud Universitair Medisch CentrumVrije Universiteit AmsterdamNorges ForskningsrådU.S. Department of EnergyEisaiNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekMinistero della SaluteEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsEpilepsy SocietySimons Foundation Autism Research InitiativeZonMwAccareNovo NordiskNational Institute for Health and Care ResearchJohn S. Dunn FoundationParents Against Childhood EpilepsyInstituto de Salud Carlos IIIRadboud UniversiteitIndiana State Department of HealthAutism SpeaksUniversity of Texas Health Science Center at HoustonUniversitair Medisch Centrum GroningenEli Lilly and Company
Mots-clésGeneralizability theorySample size determinationNeuroimagingSample (material)Brain sizeRange (aeronautics)Variance (accounting)PsychologyMedicineStatisticsDevelopmental psychologyMathematicsNeuroscienceAccounting

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Structural neuroimaging data have been used to compute an estimate of the biological age of the brain (brain-age) which has been associated with other biologically and behaviorally meaningful measures of brain development and aging. The ongoing research interest in brain-age has highlighted the need for robust and publicly available brain-age models pre-trained on data from large samples of healthy individuals. To address this need we have previously released a developmental brain-age model. Here we expand this work to develop, empirically validate, and disseminate a pre-trained brain-age model to cover most of the human lifespan. To achieve this, we selected the best-performing model after systematically examining the impact of site harmonization, age range, and sample size on brain-age prediction in a discovery sample of brain morphometric measures from 35,683 healthy individuals (age range: 5-90 years; 53.59% female). The pre-trained models were tested for cross-dataset generalizability in an independent sample comprising 2,101 healthy individuals (age range: 8-80 years; 55.35% female) and for longitudinal consistency in a further sample comprising 377 healthy individuals (age range: 9-25 years; 49.87% female). This empirical examination yielded the following findings: (1) the accuracy of age prediction from morphometry data was higher when no site harmonization was applied; (2) dividing the discovery sample into two age-bins (5-40 years and 40-90 years) provided a better balance between model accuracy and explained age variance than other alternatives; (3) model accuracy for brain-age prediction plateaued at a sample size exceeding 1,600 participants. These findings have been incorporated into CentileBrain [ https://centilebrain.org/#/brainAGE2 ], an open-science, web-based platform for individualized neuroimaging metrics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,090
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,176
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,910
Score d'incertitude au seuil0,477

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0900,176
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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