Longitudinal transcriptomic and epigenetic analysis in astronauts reveals dynamic immune response to spaceflight
Notice bibliographique
Résumé
Abstract With the advance of the space industry, the number of astronauts is increasing exponentially. A better understanding of the molecular changes in astronauts in response to spaceflight is required. Here we studied the transcriptomic and epigenetic changes that are subjected to spaceflight. We analyzed the blood samples of two astronauts collected at three timepoints of two weeks before (T0), twenty-four hours after (T2) and three months after (T3) spaceflight. We found monocytes were downregulated at T2 after the spaceflight and reversed to baseline T0 after three months of post-spaceflight at T3. Transcriptomic analysis identified two groups of genes that showed distinct expression patterns, one with transient up-regulation of the expression immediately after spaceflight and another one with transient down-regulation. Pathway analysis of the two groups revealed that protein modification pathway and cell cycle pathway were enriched, possibly supporting the conversion of monocytes to macrophages via autophagy. Epigenetic analysis identified four methylation patterns that showed transient and persistent changes, enriched in the nervous system development pathway and cell apoptosis pathway. Region-level methylation responses point to the genes involved in bone diseases, such as FBLIM1, IHH, and SCAMP2. eQTM analysis suggested a link between RNA transcriptional activity and DNA methylation through transcriptional regulator ZNF684. In conclusion, our longitudinal transcriptomic and epigenetic analysis in astronauts provides a comprehensive view of the physiological impact of spaceflight on human biology that potentially has systemic large short-term and smaller long-term effects on bodily functions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».