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Enregistrement W4388526293 · doi:10.1128/aem.00987-23

The effect of hydrostatic pressure on the activity and community composition of hydrocarbon-degrading bacteria in Arctic seawater

2023· article· en· W4388526293 sur OpenAlexfundno aff
Angeliki Marietou, Jennie Spicker Schmidt, Martin Reinhard Rasmussen, Alberto Scoma, Søren Rysgaard, Leendert Vergeynst

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFisheries and Oceans CanadaGovernment of CanadaVillum FondenAarhus Universitet
Mots-clésSeawaterHydrostatic pressureBacteriaHydrocarbonComposition (language)Hydrostatic equilibriumEnvironmental chemistryArcticChemistryEnvironmental scienceBiologyEcologyOrganic chemistryThermodynamics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT There is a renewed interest in hydrocarbon biodegradation in Arctic seawaters due to increasing ship traffic and risk for oil spills. Most studies, however, fail to address the effect of increasing pressure as an environmental parameter. Here, we conducted a series of pressurized enrichments (0.1–30 MPa, 4°C) inoculated with a 100-day-old hydrocarbon-degrading biofilm collected from 615 m deep in Arctic seawater. Cell-specific CO 2 production rates provided a clear summary of the observed microbial activity: a bloom of a hydrocarbon degrading-biofilm generating 0.82–0.90 fmol CO 2 ⋅bacterial gene −1 ⋅day −1 at 0.1–8 MPa, but undetectable activity at 30 MPa until day 6. At 30 MPa, the microbial activity increased between days 6 and 34 with an average rate of 0.36 ± 0.08 fmol CO 2 ⋅bacterial gene −1 ⋅day −1 . Amplicon sequencing revealed no differences in the microbial community composition at 0.1–12 MPa. While the typical Arctic alkane degraders Oleispira and Shewanella were abundant across all hydrostatic pressures and over time, Colwellia, Neptunomonas , and Kiloniella were significantly enriched solely at 30 MPa. Our results suggest that the physiological adaptations of psychrophilic bacteria to thrive at sub-zero temperature make Arctic oil degraders tolerant to mild hydrostatic pressures of up to 12 MPa, whereas temperate climate communities have shown hydrostatic pressure-induced inhibition at 10–15 MPa in comparable studies. The activity of hydrocarbon degraders in sinking marine oil snow in the Arctic may remain unaffected down to depths of about 1,200 m, after which hydrostatic pressure can significantly affect hydrocarbon degradation at increasing depths down to 3,000 m. IMPORTANCE Increased ship traffic in the Arctic region raises the risk of oil spills. With an average sea depth of 1,000 m, there is a growing concern over the potential release of oil sinking in the form of marine oil snow into deep Arctic waters. At increasing depth, the oil-degrading community is exposed to increasing hydrostatic pressure, which can reduce microbial activity. However, microbes thriving in polar regions may adapt to low temperature by modulation of membrane fluidity, which is also a well-known adaptation to high hydrostatic pressure. At mild hydrostatic pressures up to 8–12 MPa, we did not observe an altered microbial activity or community composition, whereas comparable studies using deep-sea or sub-Arctic microbial communities with in situ temperatures of 4–5°C showed pressure-induced effects at 10–15 MPa. Our results suggest that the psychrophilic nature of the underwater microbial communities in the Arctic may be featured by specific traits that enhance their fitness at increasing hydrostatic pressure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,183
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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