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Enregistrement W4388529073 · doi:10.1093/jas/skad281.511

PSIX-19 Association of the Rumen Microbiota with Carcass Merit and Beef Quality

2023· article· en· W4388529073 sur OpenAlexaff
Devin B. Holman, Katherine E. Gzyl, Haley Scott, N. Prieto, Ó. López-Campos

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueRuminant Nutrition and Digestive Physiology
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMarbled meatRumenIntramuscular fatBiologyBeef cattleMicrobiomeAnimal scienceRuminantLatin squareCarcass weightFood scienceBiotechnologyBody weightFermentationAgronomyPastureGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The microbial community in the rumen has an important role in the health and production of beef cattle providing up to 70% of the daily energy requirements from the metabolism of otherwise non-digestible dietary carbohydrates. Diet is often the largest determinant of rumen microbiome composition, but it is also affected by host age, genetics, and sex. Performance attributes such as average daily gain and feed efficiency have all been linked to the rumen microbiome and recent studies with relatively small numbers of cattle have also suggested there may be an association with certain beef quality traits such as marbling, which largely determines the carcass value. Thus, the objective of this study was to evaluate the association of the rumen microbiota with carcass merit and beef quality traits. Two hundred steers were slaughtered, and rumen samples were collected immediately post-slaughter. Subsequently, carcass merit and meat quality attributes were evaluated. The rumen microbiota of these animals was then characterized using 16S rRNA gene sequencing. Although we did not identify a significant association between marbling score and the structure of the rumen microbiota (PERMANOVA; P > 0.05), there were significant associations between rumen microbial community structure and commercial weight, dressed weight percentage, drip loss, and intramuscular fat content (P < 0.05). There were also individual bacterial taxa that were correlated with various carcass merit and beef quality traits. Members of the Acidaminococcus genus were negatively associated with both intramuscular fat content and marbling score (P < 0.10) while Coprococcus, Christensenellaceae R-7 group, Lachnospiraceae NK3A20 group, Moryella, and Prevotella were among those genera positively correlated with intramuscular fat content (P < 0.10). Christensenellaceae R-7 group, Lachnospiraceae NK3A20 group, Moryella, and Prevotella were also significantly associated with dressed weight percentage. Commercial weight was positively correlated with the genera Catonella, Prevotellaceae NK3B31 group, Pseudoramibacter, Selenomonas, and Sutterella and negatively associated with Oribacterium and Ruminococcaceae UCG-001 (P < 0.10). Therefore, bacteria within these genera may be ideal targets for future microbiome-based strategies to improve carcass merit and beef quality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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