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Enregistrement W4388531650 · doi:10.1093/jas/skad281.036

132 Genetics of Stress Hormone Concentrations in Hair of Healthy Nursery Pigs and Their Relationship with Back Test Responses

2023· article· en· W4388531650 sur OpenAlexafffundabout
Fazhir Kayondo, hayder al-shanoon, Yolande M. Seddon, Dylan Carette, Carmen Cole, David M. Janz, Frédéric Fortin, John C. S. Harding, Michael K. Dyck, Graham Plastow, Jack C. M. Dekkers

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal Behavior and Welfare Studies
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversity of SaskatchewanCentre de Développement du Porc du Québec
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and AgricultureGenome CanadaU.S. Department of Agriculture
Mots-clésHeritabilityBiologyGenetic correlationLitterHormoneEndocrinologyRumpInternal medicineAnimal sciencePhysiologyGenetic variationMedicineGeneticsEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cortisol and dehydroepiandrosterone (DHEA) are circulating adrenal hormones whose concentration in the blood varies in the face of infectious and non-infectious stressors. Their incorporation into hair makes their concentration in hair a robust retrospective assessment of HPA-axis activity as a measure of the stress response of an animal over the period of hair growth. Our objective was to estimate the genetic parameters of hormone concentrations in the hair of healthy pigs and their genetic correlation with responses to the standard back-test. Hair shaved from the rump area of 871 Large White X Landrace barrows (~40 d of age) from 6 breeding companies, maintained in a high-health nursery, was analyzed for cortisol and DHEA concentrations. Behavioral responses to a 60 s standard back-test were obtained at ~26 d of age, including the number of vocalizations (VN) and struggles (SN) and the intensity of the vocalizations (VI) and struggles (SI). All pigs were genotyped with a 50K SNP panel and imputed up to 650K. Estimates of heritability of log-transformed levels of cortisol and DHEA using univariate animal models were 0.26 ± 0.08 and 0.00, respectively, while litter effects explained 0.19 ± 0.05 and 0.09 ± 0.04 of the phenotypic variance, respectively. Back-test responses were more heritable, ranging from 0.34 ± 0.08 (VI) to 0.58 ± 0.08 (VN), with small litter effects (0.00 to 0.06). Estimates of genetic correlations using bivariate animal models were high among the back-test responses, ranging from 0.58 ± 0.16 for SN-VN to 0.96 ± 0.04 for VN-VI and 0.99 ± 0.10 for SN-SI. Estimates of genetic correlations of cortisol with back-test responses ranged from low (0.08 ± 0.23 with SI) to moderate (0.66 ± 0.27 with SN). We conclude that the concentration of cortisol in the hair of healthy nursery pigs is a heritable molecular phenotype and is genetically correlated with responses to the back-test. In subsequent research, their potential as indicator traits to select for disease resilience will be investigated. This study was funded by Genome Canada, PigGen Canada, and USDA-NIFA grant # 2021-67015-34562.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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