The Reactome Pathway Knowledgebase 2024

2023· article· en· 1 339 citations· W4388539829 sur OpenAlex· 10.1093/nar/gkad1025

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,048

Tête enseignante GPT0,357

Écart entre enseignants: 0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation: score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

The Reactome Knowledgebase (https://reactome.org), an Elixir and GCBR core biological data resource, provides manually curated molecular details of a broad range of normal and disease-related biological processes. Processes are annotated as an ordered network of molecular transformations in a single consistent data model. Reactome thus functions both as a digital archive of manually curated human biological processes and as a tool for discovering functional relationships in data such as gene expression profiles or somatic mutation catalogs from tumor cells. Here we review progress towards annotation of the entire human proteome, targeted annotation of disease-causing genetic variants of proteins and of small-molecule drugs in a pathway context, and towards supporting explicit annotation of cell- and tissue-specific pathways. Finally, we briefly discuss issues involved in making Reactome more fully interoperable with other related resources such as the Gene Ontology and maintaining the resulting community resource network.

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La notice

Revue: Nucleic Acids Research
Thématique: Genetics, Bioinformatics, and Biomedical Research
Domaine: Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens: University of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnaires: National Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthNational Human Genome Research InstituteUniversity of TorontoEuropean Bioinformatics Institute
Mots-clés: BiologyComputational biologyGenetics
Résumé présent dans OpenAlex: oui
API: /api/v1/works/W4388539829