MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4388540944 · doi:10.1371/journal.pone.0294154

Neuroanatomical location of brain metastases from solid tumours based on pathology: An analysis of 511 patients with a comparison to the provided clinical history

2023· article· en· W4388540944 sur OpenAlexaff
Michael Bonert, Alison Berzins, Housne Begum, Jens Schittenhelm, Jian‐Qiang Lu, Rosalyn A. Juergens, Anand Swaminath, Jean‐Claude Cutz, Asghar Naqvi

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBrain Metastases and Treatment
Établissements canadiensHamilton Health SciencesToronto Metropolitan UniversityMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePathologySurgical pathologyNeuropathologyMetastasisBrain metastasisAnatomical pathologyRadiologyCancerInternal medicineDiseaseImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brain metastases are a frequent occurrence in neuropathology practices. The literature on their neuroanatomical location is frequently derived from radiological analyses. This work examines brain metastases through the lens of pathology specimens. All brain surgical pathology reports for cases accessioned 2011-2020 were retrieved from a laboratory. Specimens were classified by neuroanatomical location, diagnosis and diagnostic category with a hierarchical free text string-matching algorithm (HFTSMA) and also subsequently audited. All reports classified as probable metastasis were reviewed by a pathologist. The provided history was compared to the final categorization by a pathologist. The cohort had 4,625 cases. The HFTSMA identified 854 cases (including metastases from a definite primary, metastases from primary not known and improperly classified cases). 514/854 cases had one definite primary site per algorithm and on report review 538/854 cases were confirmed as such. The 538 cases originated from 511 patients. Primaries from breast, gynecologic tract, and gastrointestinal tract not otherwise specified were most frequently found in the cerebellum. Kidney metastases were most frequently found in the occipital lobe. Lung, metastatic melanoma and colorectal primaries were most commonly found in the frontal lobe. The provided clinical history predicted the primary in 206 cases (40.3%), was discordant in 17 cases (3.3%) and non-contributory in 280 cases (54.8%). The observed distribution of the metastatic tumours in the brain is dependent on the primary site. In the majority (54.8%) of cases, the provided clinical history was non-contributory; this suggests surgeon-pathologist communication may have the potential for optimization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,344

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,085
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetBrain Metastases and TreatmentTravaux en français237 207