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Enregistrement W4388597700 · doi:10.1016/j.rpth.2023.100771

PB0543 Like Heparin, Polyphosphate Promotes the Formation of a Ternary Complex with Thrombin and Fibrin

2023· article· en· W4388597700 sur OpenAlexaff
Xiaolan Yao, James C. Fredenburgh, Jeffrey I. Weitz

Notice bibliographique

RevueResearch and Practice in Thrombosis and Haemostasis · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and Angioedema
Établissements canadiensThrombosis and Atherosclerosis Research InstituteMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolyphosphateFibrinTernary complexThrombinHeparinTernary operationChemistryBiochemistryMedicineInternal medicineImmunologyComputer sciencePlateletEnzymePhosphate

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Heparin binds thrombin and fibrin and promotes the formation of a ternary heparin-thrombin-fibrin complex that protects thrombin from inhibition by antithrombin.Polyphosphate ( polyP) is a procoagulant polyanion released from activated platelets that, like heparin, binds thrombin and fibrin(ogen).Aims: To determine whether polyP promotes thrombin binding to fibrin, thereby forming a ternary complex that protects thrombin from inhibition by antithrombin.Methods: The polyP-fibrinogen interaction was quantified using surface plasmon resonance, whereas the binding of thrombin to fibrin in the absence or presence of polyP or heparin was quantified by measuring thrombin activity in clot supernatants.The protection of bound thrombin from inhibition by the antithrombin-heparin complex was evaluated by monitoring thrombin activity, while the procoagulant activity of fibrin-bound thrombin was quantified by incubation with FITC-fibrinogen and monitoring fibrin accretion.Results: PolyP binds fibrinogen with a Kd of 108 nM.PolyP and heparin promote thrombin binding to fibrin clots by 48% and 30%, respectively (Figure).Thrombin binds fibrin with a Kd of 5.6 µM in the absence of a polyanion; the affinity is 3-and 14-fold higher in the presence of polyP or heparin, respectively (Table ).The heparin-catalyzed rate of thrombin inhibition by antithrombin is 14-fold lower in the presence of fibrin than in its absence.In contrast, with polyP, the rate of inhibition is 3-fold faster with fibrin than without it.Whereas fibrin-bound thrombin promotes fibrin accretion in the presence of heparin, there is no promotion of fibrin accretion in the presence of polyP.Image: Effect of polyP and unfractionated heparin in thrombin binding to fibrin clot. Conclusion(s):Like heparin, polyP binds thrombin and fibrin(ogen) and promotes thrombin binding to fibrin.Whereas thrombin assembled within the heparin-thrombin-fibrin complex is protected from inhibition by antithrombin and is procoagulant, thrombin within the polyP-thrombinfibrin is not.These findings identify important differences in the mechanisms and consequences of polyanion interactions with thrombin and fibrin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,221
Tête enseignante GPT0,435
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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