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Enregistrement W4388598032 · doi:10.1016/j.rpth.2023.101382

PB0246 FXIII Deficiency: A Genetic Diagnostic Dilemma

2023· article· en· W4388598032 sur OpenAlexaff
Vanessa Bouskill, Jodie Odame, Clare Malcolmson, Cindy Wakefield, Elizabeth Paradis, Tammy Bourque, D. Lillicrap, Orla Rawley, Manuel Carção

Notice bibliographique

RevueResearch and Practice in Thrombosis and Haemostasis · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of TorontoQueen's UniversityHealth Sciences NorthHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDilemmaGeneticsBiologyPhilosophyEpistemology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Factor XIII (FXIII) deficiency is a rare, autosomal recessive bleeding disorder.Plasma FXIII is a protransglutaminase which is composed of two alpha-subunits (FXIII-A), and two beta-subunits (FXIII-B).FXIII deficiency is commonly diagnosed via clot lysis or quantitative XIII activity assay, the latter of which is capable of discriminating FXIII-A deficiency, FXIII-B deficiency, or anti-FXIII antibodies.Genetic analysis can assist in confirming diagnosis.Aims: We describe a case of severe FXIII deficiency in which genetics were initially confounding.Methods: We conducted a retrospective chart review.Consent was obtained from the patient/family.Results: A male subject presented at birth with prolonged umbilical stump bleeding and multiple bleeding episodes in childhood.Laboratory evaluations revealed: hemoglobin 126 g/L, platelet count 291 × 109/L, PTT 25 sec, INR 1.1, fibrinogen activity 1.5 g/L, FVIII 1.20 IU/mL, VWF:Ag 0.87 IU/mL, VWF:Act 0.68 IU/mL, FIX 0.93 IU/mL, FXIII: Ag < 0.04 IU/mL, FXIII:Act < 0.14 IU/mL, and FXIII-A < 0.02 IU/mL.FXIII:Act were 0.85 IU/mL and 0.83 IU/mL for the mother and father respectively.Genetic analysis revealed presence of two likely pathogenic class 4 variants in his FXIII-A gene: c.57_58delCT p.Ser20X and c.2111G>A p.Arg704Gln.He also had a variant in the FXIII-B gene: c.344G>A p.Arg115His.This FXIII-B variant was also found in the father who was homozygous but unaffected.We concluded this variant did not produce a pathogenic effect.A diagnosis of severe FXIII-A deficiency was made and he was started on FXIII replacement.Conclusion(s): While genetic evaluation can elucidate a diagnosis, in this case our patient had variants in both the FXIII-A and FXIII-B subunits.Parental testing was essential for interpreting that the FXIII-B subunit variant was not clinically contributory as it was found to be homozygous in an unaffected parent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,145
Tête enseignante GPT0,451
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
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