Amoebozoan testate amoebae illuminate the diversity of heterotrophs and the complexity of ecosystems throughout geological time
Notice bibliographique
Résumé
Heterotrophic microbial eukaryotes play a pivotal role in aquatic and terrestrial ecosystems, contributing to carbon and nutrient cycles. These microorganisms, capable of phagocytosis, act as predators of bacterial communities and other microeukaryotes, occupying a significant position in complex food webs. The timing of the origin and diversification of heterotrophic microeukaryotes remain unclear. Fossil evidence and molecular data suggest that the emergence of predatory microeukaryotes and the transition to a eukaryote-dominant marine environment occurred around 800 million years ago (mya). Vase-shaped microfossils (VSMs), the fossil record linked to Arcellinida testate amoebae, represent the oldest known evidence of heterotrophic microeukaryotes in marine environments and terrestrial habitats. In this study, we investigate the early divergence and diversification of Arcellinida and related amoebozoan taxa using a relaxed molecular clock approach. Phylogenomic reconstructions reveal a well-resolved tree of amoebozoan testate amoebae, including a monophyletic Arcellinida with three suborders and five infraorders. Through calibration using fossils and rigorous clock models, we estimate the timing of diversification of Arcellinida during the early Neoproterozoic (886 - 764 mya), shedding light on the expansion of life during this period. Our results suggest an established biological complexity in shallow marine ecosystems, involving both phototrophic and heterotrophic microeukaryotes during the Neoproterozoic, followed by an invasion of freshwater systems potentially during Cryogenian and subsequent diversification of Arcellinida in the Phanerozoic. Overall, these findings provide valuable insights into heterotrophic microeukaryotes' evolutionary history and ecological significance in Earth's ecosystems.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».