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Enregistrement W4388650559 · doi:10.19189/map.2022.omb.sc.2089688

Inferring northern peatland methane emissions from testate amoebae: A proof of concept study

2023· article· en· W4388650559 sur OpenAlexaff
Alicia Frésard, Matthieu Mulot, Guillaume Bertrand, Alexandre Lhosmot, Laure Gandois, Eeva‐Stiina Tuittila, Julie Loisel, Julie Talbot, Sanna Saarnio, Elisa Männistö, Luc G. Pelletier, Michelle Garneau, Edward A. D. Mitchell

Notice bibliographique

RevueMires and Peat · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesCanton de NeuchâtelItä-Suomen Yliopisto
Mots-clésTestate amoebaePeatMethaneEnvironmental scienceEcologyBurden of proofBiologyPolitical science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peatlands are efficient carbon sinks due to waterlogged soils causing oxygen depletion and slowing organic matter decomposition, leading to peat accumulation. However, peatlands are also a natural source of methane (CH4), a powerful greenhouse gas, to the atmosphere. Methane production (by methanogens) and oxidation (by methanotrophs) are controlled by water table depth, soil temperature and hydrochemistry. Measuring CH4 emissions is resource demanding. Several measurements method are used, which introduces potential bias for comparisons among studies. Thus, a simple and reliable indicator tool would be desirable for both researchers and managers. Currently, such a tool does not exist. Testate amoebae (TA), an abundant and diverse group of shelled protists occurring in peatlands, are well-established proxies of present water table depth (WTD). As their shells are well preserved in peat, they are commonly used to infer past hydrological changes using predictive mathematical models called transfer functions. As CH4 emissions are also tightly linked to WTD, and although TA are not directly involved in CH4 production or consumption, we hypothesised that CH4 emissions would be significantly correlated to TA community composition and could therefore be inferred from TA communities living in peatland mosses. We tested this hypothesis using compilations of CH4 plot emissions measurements from European and North American bogs and fens, and TA data from moss samples collected from the same plots. Testate amoeba communities were significantly correlated to CH4 fluxes. As our models were based on several independent studies for both flux measurements and TA communities, methodological differences among studies (e.g., CH4 emission measurements, TA taxonomy) may potentially cause bias in the model. Nevertheless, the results are promising, and this proof-of-concept study suggests that past and present peatland CH4 emissions could be inferred from TA shells preserved in peat over centuries and in mosses growing at the surfaces of peatlands.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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