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Enregistrement W4388659289 · doi:10.1080/07060661.2023.2274327

Comparative proteomic analysis of the moderately resistant and susceptible peanut cultivars during infestation by <i>Cylindrocladium parasiticum</i>

2023· article· en· W4388659289 sur OpenAlexvenueno aff
Xinyu Chen, Mei Luo, Meimei Xiang, Lina Xiong, Yongxin Shu, Guohui Yu, Zhangyong Dong, Yunhao Sun

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyKEGGPhenylpropanoidBotanyJasmonic acidGeneGene expressionBiosynthesisBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cylindrocladium parasiticum Crous, Wingfield & Alfenas, the causal agent of Cylindrocladium black rot of peanut, has led to economic losses in China. However, the response of peanut plant to C. parasiticum is poorly understood. Here, two contrasting peanut cultivars, T09 (C. parasiticum-moderately resistant) and P562 (C. parasiticum-susceptible) were used for comparative analysis of protein profiles in root segment of plant tissues in responses to C. parasiticum infection. Proteomic profiling identified 1647 and 391 differentially accumulated proteins (DAPs) in P562 and T09 relative to uninoculated control, respectively. A total of 350 and 1095 DAPs were identified between P562 and T09 after 9 day(s) post infection (dpi), respectively. Functional categorization showed that C. parasiticum-responsive proteins were mainly involved in catalytic activity and binding functions. KEGG pathway analysis indicated both moderately resistant and susceptible peanut cultivars can regulate gene expression in the phenylpropanoid pathway, terpenoid backbone biosynthesis, SA, and JA pathways to induce defensive genes and protein expression which enhances plant defence or susceptibility capacity. However, MAPK signal pathway was more pronounced in moderately resistant peanut cultivar T09. We also observed an increase of CYP73A100 involved in phenylpropanoid and flavonoid biosynthesis pathways in susceptible peanut ecotype P562, while decrease in moderately resistant interaction. Additionally, there was a marked activation of brassinosteroid biosynthesis in T09, which indicated a possible involvement of activation of plant immune response in moderately resistant responses of peanut to C. parasiticum. This study provides some insights into molecular networks involved in cellular and physiological responses to C. parasiticum in peanut.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,942
Score d'incertitude au seuil0,942

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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