MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4388670936 · doi:10.1111/zph.13093

Historical associations and spatiotemporal changes of pathogen presence in ticks in Canada: A systematic review

2023· review· en· W4388670936 sur OpenAlexafffundabout
Kirsten E. Crandall, Virginie Millien, Jeremy T. Kerr

Notice bibliographique

RevueZoonoses and Public Health · 2023
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHydro-Québec
Mots-clésIxodes scapularisTickBiologyPathogenTick-borne diseaseAnaplasma phagocytophilumBorrelia burgdorferiLyme diseaseIxodesVector (molecular biology)BorreliaHost (biology)AnaplasmaZoologyIxodidaeVirologyEcologyMicrobiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Starting in the early 20th century, ticks and their pathogens have been detected during surveillance efforts in Canada. Since then, the geographic spread of tick vectors and tick-borne pathogens has steadily increased in Canada with the establishment of tick and host populations. Sentinel surveillance in Canada primarily focuses on Ixodes scapularis, which is the main vector of Borrelia burgdorferi, the bacterium causing Lyme disease. Other tick-borne pathogens, such as Anaplasma, Babesia, and Rickettsia species, have lower prevalence in Canada, but they are emerging or re-emerging in tick and host populations. AIMS/MATERIALS & METHODS: Here, we assessed the historical associations between tick vectors, hosts and pathogens and identified spatiotemporal clusters of pathogen presence in ticks in Canada using data extracted from the literature. RESULTS: Approximately one-third of ticks were infected with a pathogen, and these ticks were feeding primarily on bird and mammal hosts. B. burgdorferi was the most detected pathogen and I. scapularis harboured the greatest number of pathogens. We identified several spatial outliers of high pathogen presence in ticks in addition to five spatiotemporal clusters in southern Canada, all of which have long-established tick populations. Six spatiotemporal clusters of high pathogen presence in ticks were also identified based on surveillance method, with four clusters associated with passive surveillance and two clusters associated with active surveillance. DISCUSSION: Our review represents the first systematic assessment of the literature that identifies historical associations and spatiotemporal changes in tick-host-pathogen disease systems in Canada over broad spatial and temporal scales. CONCLUSION: As distinct spatiotemporal clusters were identified based on surveillance method, it is imperative that surveillance efforts employ standardized methods and data reporting to comprehensively assess the presence, spread and risk of tick-borne pathogens in tick and host populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,660
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueZoonoses and Public HealthMême sujetVector-borne infectious diseasesTravaux en français237 207