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Enregistrement W4388734977 · doi:10.3389/fmicb.2023.1294518

The secondary metabolite hydrogen cyanide protects Pseudomonas aeruginosa against sodium hypochlorite-induced oxidative stress

2023· article· en· W4388734977 sur OpenAlexafffund
Waleska Stephanie da Cruz Nizer, Madison Elisabeth Adams, Vasily Inkovskiy, Carole Beaulieu, Joerg Overhage

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPseudomonas aeruginosaMicrobiologyMutantSodium hypochloriteChemistryVirulenceOxidative stressBacteriaBiochemistryBiologyGeneOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The high pathogenicity of Pseudomonas aeruginosa is attributed to the production of many virulence factors and its resistance to several antimicrobials. Among them, sodium hypochlorite (NaOCl) is a widely used disinfectant due to its strong antimicrobial effect. However, bacteria develop many mechanisms to survive the damage caused by this agent. Therefore, this study aimed to identify novel mechanisms employed by P. aeruginosa to resist oxidative stress induced by the strong oxidizing agent NaOCl. We analyzed the growth of the P. aeruginosa mutants ΔkatA, ΔkatE, ΔahpC, ΔahpF, ΔmsrA at 1 μg/mL NaOCl, and showed that these known H2O2 resistance mechanisms are also important for the survival of P. aeruginosa under NaOCl stress. We then conducted a screening of the P. aeruginosa PA14 transposon insertion mutant library and identified 48 mutants with increased susceptibility toward NaOCl. Among them were 10 mutants with a disrupted nrdJa, bvlR, hcnA, orn, sucC, cysZ, nuoJ, PA4166, opmQ, or thiC gene, which also exhibited a significant growth defect in the presence of NaOCl. We focussed our follow-up experiments (i.e., growth analyzes and kill-kinetics) on mutants with defect in the synthesis of the secondary metabolite hydrogen cyanide (HCN). We showed that HCN produced by P. aeruginosa contributes to its resistance toward NaOCl as it acts as a scavenger molecule, quenching the toxic effects of NaOCl.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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