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Enregistrement W4388757837 · doi:10.1109/uemcon59035.2023.10315982

Machine-Learning Assisted Segmentation to Assess the Outcomes of Tissue Ablation with Nanosecond Pulses

2023· article· en· W4388757837 sur OpenAlexaboutno aff
Mohammad Shahab Uddin, Vincent Yi, Hongfang Zhang, Shu Xiao

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Inactivation Methods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAblationNanosecondSegmentationWaveformArtificial intelligenceComputer sciencePulse (music)Irreversible electroporationLaser ablationMaterials scienceBiomedical engineeringComputer visionOpticsPhysicsMedicineElectroporationLaserChemistryTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-intensity electrical pulsing has emerged as a robust, versatile, and minimally invasive method for ablating tumors and unwanted tissues. The pulse duration varies from nanoseconds to milliseconds, encompassing three primary ablation pulses: Irreversible electroporation (IRE, us-ms), high-frequency IRE (HFIRE, bipolar $\mu{\mathrm{s}}$), and nanosecond pulses (nsEP). In this study, we concentrated on utilizing a plant tissue model (Yukon Gold) to explore the outcomes of ablations using three different pulse waveforms: unipolar 100 $\mu{\mathrm{s}}$ (IRE), Bipolar ±300 ns, and Unipolar 300 ns. The images of the treated potatoes underwent analysis using a U-net machine learning model trained with manually segmented ablation areas as the ground truth. The treated tissues were evaluated at multiple time points. The trained model’s performance was validated on unseen images, achieving an intersection over union (IoU) of 99.41%. Subsequently, we employed the trained model on unsegmented potato images to identify ablation areas. This study aims to investigate the impact of pulse waveforms on the tumor ablation area’s (AA) size, the homogeneity (HG) of the ablation, and the presence of a distinct boundary, known as boundary gradient (BG). Our findings indicated that the bipolar nanosecond pulse seems to be the optimal waveform for tissue ablation. Additionally, we demonstrated that while the Segment Anything Model (SAM), a large segmentation model developed by Meta, excelled in various zero-shot segmentation applications, it failed to precisely segment the ablation area. This suggests that further efforts are necessary to adapt SAM for specialized tasks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,193

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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