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Enregistrement W4388763368 · doi:10.20870/oeno-one.2023.57.4.7663

Metagenomic ecosystem monitoring of soft scale insects and mealybug communities

2023· article· en· W4388763368 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueOENO One · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueResearch on scale insects
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWine AustraliaAustralian GovernmentAlberta Water Research Institute
Mots-clésMealybugBiologyVineyardMetagenomicsCoccidaeIdentification (biology)EcologyBotanyHemipteraPEST analysisHorticultureHomoptera

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soft scale insects and mealybugs are phloem-feeding Hemipterans that are considered major pests in agriculture and horticulture throughout the world. However, correct taxonomic identification in the field can be difficult, making it hard for growers to implement control strategies. In viticulture, soft scale insects are a major issue due to their ability to secrete honeydew, which facilitates the development of sooty mould, and their propensity for being transmission vectors of several viral diseases of grapevine. To facilitate the rapid identification and quantification of vineyard-associated insects a metagenomic-based bioinformatic pipeline (MitoMonitor) was developed for generalised ecosystem monitoring, which automated the assembly and classification of insect mitochondrial genomes from shotgun sequencing data using the Barcode of Life Database API. The proof-of-concept application of MitoMonitor on metagenomic data obtained from eight samples from South Australian vineyards led to the identification of Parthenolecanium corni (European fruit scale)—which was thought to be absent in Australian vineyards—as the dominant coccoid species across the samples, with less frequent, and also lower abundance of Pseudococcus viburni (obscure mealybug) and Pseudo. longispinus (long-tailed mealybug). In addition, parisitoidism by Coccophagus scutellaris (Aphelinidae) wasps was also detected. The discovery of Parth. corni as a member of scale communities in these samples has significant implications for the development of effective control strategies for this important group of pests in affected areas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,860
Score d'incertitude au seuil0,147

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,097
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle