MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4388771197 · doi:10.3346/jkms.2023.38.e395

Polygenic Risk Score for Cardiovascular Diseases in Artificial Intelligence Paradigm: A Review

2023· review· en· W4388771197 sur OpenAlex
Narendra N. Khanna, Manasvi Singh, Mahesh Maindarkar, Ashish Kumar, Amer M. Johri, Laura Mentella, John R Laird, Kosmas I. Paraskevas, Zoltán Ruzsa, Narpinder Singh, Mannudeep K. Kalra, Jose Fernandes E. Fernandes, Seemant Chaturvedi, Andrew Nicolaides, Vijay Rathore, Inder M. Singh, Jagjit S. Teji, Mostafa Al-Maini, Esma R. Isenović, Vijay Viswanathan, Puneet Khanna, Mostafa M. Fouda, Luca Saba, Jasjit S. Suri

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Korean Medical Science · 2023
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of TorontoQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArtificial intelligencePolygenic risk scoreMachine learningDiseaseComputer scienceRisk assessmentFramingham Risk ScoreCurse of dimensionalityMedicineInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cardiovascular disease (CVD) related mortality and morbidity heavily strain society. The relationship between external risk factors and our genetics have not been well established. It is widely acknowledged that environmental influence and individual behaviours play a significant role in CVD vulnerability, leading to the development of polygenic risk scores (PRS). We employed the PRISMA search method to locate pertinent research and literature to extensively review artificial intelligence (AI)-based PRS models for CVD risk prediction. Furthermore, we analyzed and compared conventional vs. AI-based solutions for PRS. We summarized the recent advances in our understanding of the use of AI-based PRS for risk prediction of CVD. Our study proposes three hypotheses: i) Multiple genetic variations and risk factors can be incorporated into AI-based PRS to improve the accuracy of CVD risk predicting. ii) AI-based PRS for CVD circumvents the drawbacks of conventional PRS calculators by incorporating a larger variety of genetic and non-genetic components, allowing for more precise and individualised risk estimations. iii) Using AI approaches, it is possible to significantly reduce the dimensionality of huge genomic datasets, resulting in more accurate and effective disease risk prediction models. Our study highlighted that the AI-PRS model outperformed traditional PRS calculators in predicting CVD risk. Furthermore, using AI-based methods to calculate PRS may increase the precision of risk predictions for CVD and have significant ramifications for individualized prevention and treatment plans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,995
Score d'incertitude au seuil0,988

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle