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Enregistrement W4388783415 · doi:10.1002/trc2.12429

SHIP1 therapeutic target enablement: Identification and evaluation of inhibitors for the treatment of late‐onset Alzheimer's disease

2023· article· en· W4388783415 sur OpenAlexfundno aff
Cynthia D. Jesudason, Emily R. Mason, Shaoyou Chu, Adrian L. Oblak, June Javens‐Wolfe, Mustapha Moussaif, Greg Durst, Philip A. Hipskind, Daniel E. Beck, Jiajun Dong, Ovini Amarasinghe, Zhong‐Yin Zhang, Adam Hamdani, Kratika Singhal, Andrew D. Mesecar, Sarah Souza, Marlene Jacobson, Jerry Di Salvo, Disha Soni, Murugesh Kandasamy, Andrea R. Masters, Sara K. Quinney, Suzanne Doolen, Hasi Huhe, Stacey J. Sukoff Rizzo, Bruce T. Lamb, Alan D. Palkowitz, Timothy I. Richardson

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia Translational Research & Clinical Interventions · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePI3K/AKT/mTOR signaling in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute on AgingNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthSchool of Medicine, Indiana UniversityPurdue UniversityPartenariat Canadien Contre Le CancerUniversity of Pittsburgh
Mots-clésDiseaseIdentification (biology)MedicineOncologyInternal medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: , it is a negative regulator of microglia function. Validated inhibitors are needed to evaluate SHIP1 as a potential therapeutic target. METHODS: We identified inhibitors and screened the enzymatic domain of SHIP1. A protein construct containing two domains was used to evaluate enzyme inhibitor potency and selectivity versus SHIP2. Inhibitors were tested against a construct containing all ordered domains of the human and mouse proteins. A cellular thermal shift assay (CETSA) provided evidence of target engagement in cells. Phospho-AKT levels provided further evidence of on-target pharmacology. A high-content imaging assay was used to study the pharmacology of SHIP1 inhibition while monitoring cell health. Physicochemical and absorption, distribution, metabolism, and excretion (ADME) properties were evaluated to select a compound suitable for in vivo studies. RESULTS: SHIP1 inhibitors displayed a remarkable array of activities and cellular pharmacology. Inhibitory potency was dependent on the protein construct used to assess enzymatic activity. Some inhibitors failed to engage the target in cells. Inhibitors that were active in the CETSA consistently destabilized the protein and reduced pAKT levels. Many SHIP1 inhibitors were cytotoxic either at high concentration due to cell stress or they potently induced cell death depending on the compound and cell type. One compound activated microglia, inducing phagocytosis at concentrations that did not result in significant cell death. A pharmacokinetic study demonstrated brain exposures in mice upon oral administration. DISCUSSION: 3-((2,4-Dichlorobenzyl)oxy)-5-(1-(piperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl) pyridine activated primary mouse microglia and demonstrated exposures in mouse brain upon oral dosing. Although this compound is our recommended chemical probe for investigating the pharmacology of SHIP1 inhibition at this time, further optimization is required for clinical studies. Highlights: Cellular thermal shift assay (CETSA) and signaling (pAKT) assays were developed to provide evidence of src homology 2 (SH2) domain-contaning inositol phosphatase 1 (SHIP1) target engagement and on-target activity in cellular assays.A phenotypic high-content imaging assay with simultaneous measures of phagocytosis, cell number, and nuclear intensity was developed to explore cellular pharmacology and monitor cell health.SHIP1 inhibitors demonstrate a wide range of activity and cellular pharmacology, and many reported inhibitors are cytotoxic.The chemical probe 3-((2,4-dichlorobenzyl)oxy)-5-(1-(piperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl) pyridine is recommended to explore SHIP1 pharmacology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,623
Score d'incertitude au seuil0,468

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,386
Tête enseignante GPT0,528
Écart entre enseignants0,143 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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