HPV genotype-specific distribution and attributable risk in cervical intraepithelial neoplasia in a referral population with a history of LSIL.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND OBJECTIVE: CINtec PLUS and cobas HPV tests (Roche) were previously ascertained for triaging an LSIL referral population [1]. As part of this study, genotype-specific distribution and attributable risk of high-risk (HR)-HPV in cervical intraepithelial neoplasia (CIN) were determined. METHODS: Archived cervical specimens in ThinPrep PreservCyt (Hologic Inc) from the LSIL referral population (n= 533) were genotyped using the Anyplex II HPV HR test (Anyplex, Seegene Inc). Since the study specimens had been in storage in ambient temperature for 31-47 months since collection, Anyplex results were compared with that of the initial cobas testing of fresh specimens to validate the suitability and stability of specimens for the present study. RESULTS: Overall, Anyplex test was positive in 63% (336/533) vs. 55.7% (297/533) for cobas test. Anyplex test performed identical to cobas test identifying 93.2% (82/88) of ⩾CIN2/adenocarcinoma in situ (AIS). Anyplex test detected genotypes 16/18 in 15.7% (36/230) ⩽CIN1 vs. 45.5% (40/88) ⩾CIN2/AIS; the corresponding figures were 13.5% (31/230) and 45.5% (40/48) for the cobas test. Genotype 16 showed increasing attribution, 13.2% in CIN1, 27.1% in CIN2 and 40% in CIN3/AIS. Of the 12 other high-risk (OHR) types collectively identified by cobas, Anyplex test specifically detected, in decreasing order, genotypes 51, 31, 35, 56, 39, and 45 as the most frequent types, often in multiple-type infections, in 64.8% ⩾CIN2. Regardless, estimated attribution was evident for each of the 12 OHR types in ⩾CIN2. Multiple-type infections were more frequent than single-type infections in all CIN grades. CONCLUSIONS: Attributable risk of all HR-HPV genotypes targeted by both Anyplex and cobas tests was evident in ⩾CIN2/AIS Testing for these genotypes in HPV primary cervical screening and cytology triage could identify those at increased risk of cervical cancer and also be beneficial in the management of LSIL referral populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».