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Enregistrement W4388879850 · doi:10.1038/s41467-023-43187-1

GAS2 encodes a 2-oxoglutarate dependent dioxygenase involved in ABA catabolism

2023· letter· en· W4388879850 sur OpenAlex
Theodor Lange, Nadiem Atiq, Maria João Pimenta Lange

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2023
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical Acid Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Toronto
Mots-clésCatabolismDioxygenaseChemistryBiochemistryEnzymeCell biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Liu et al. 1 recently reported the characterisation of Arabidopsis thaliana GAS2 (Gain of Function in ABA-modulated Seed Germination 2), which was described as an enzyme catalysing the stereospecific hydration of GA 12 to produce GA 12 16, 17-dihydro-16α-ol (DHGA 12 ). A second paper describes the conversion of GA 12 to an unidentified product by GAS2 and reports that this enzyme does not convert ABA 2 . As previously reported 3 , we did not find any conversion of [17- 14 C]-labelled or [1-,7-,12-,18- 14 C 4 ]-labelled GA 12 by GAS2. Instead, we present here data showing that the recombinant GAS2 enzyme catabolizes abscisic acid (ABA) to phaseic acid (PA) and further to a second product, putative 8’-carboxy-ABA (compound A; Fig. 1a ). Fig. 1: GAS2 is an ABA catabolising oxidase. a The proposed ABA catabolic pathway catalysed by GAS2. b Metabolism of 3’,5’,5’,7’,7’,7’- d 6 -ABA incubated with 70 µL cell lysate containing recombinant ATGA20ox1 and cofactors (negative control, top lane). Metabolism of d 6 -ABA incubated with indicated volumes of cell lysates containing recombinant GAS2 and cofactors as described in Methods. Chromatograms of characteristic single ions are shown in the first row for ABA (extracted ion m/z 194.2), in the middle row for PA ( m/z 125.2), and in the right row for compound A ( m/z 194.2). Compounds that were identified on the basis of their full scan mass spectra of the methyl ester derivatives are shown in red. Similar results were obtained with two recombinant GAS2 preparations, produced from independent isolated E.coli clones, each were incubated at seven different lysate concentrations. Full size image

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesIntégrité de la recherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,543
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle