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Enregistrement W4388940382 · doi:10.3389/fmolb.2023.1295817

Immunoinformatics and reverse vaccinology approach in designing a novel highly immunogenic multivalent peptide-based vaccine against the human monkeypox virus

2023· article· en· W4388940382 sur OpenAlexaff
Abhigyan Choudhury, Anshuman Chandra, Turki M. Dawoud, Hiba‐Allah Nafidi, N. Singh, Mohammed Bourhia

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Biosciences · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquevaccines and immunoinformatics approaches
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesKing Saud University
Mots-clésEpitopeReverse vaccinologyAntigenicityVirologyPeptide vaccineAdjuvantBiologyVaccine efficacyImmunogenicityEpitope mappingImmune systemAntigenVaccinationImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Monkeypox is a highly infectious zoonotic disease, often resulting in complications ranging from respiratory illnesses to vision loss. The escalating global incidence of its cases demands prompt attention, as the absence of a proven post-exposure treatment underscores the criticality of developing an effective vaccine. Methods: Interactions of the viral proteins with TLR2 and TLR4 were investigated to assess their immunogenic potentials. Highly immunogenic proteins were selected and subjected to epitope mapping for identifying B-cell and MHC class I and II epitopes. Epitopes with high antigenicity were chosen, considering global population coverage. A multi-target, multi-epitope vaccine peptide was designed, incorporating a beta-defensin 2 adjuvant, B-cell epitopes, and MHC class I and II epitopes. Results: The coordinate structure of the engineered vaccine was modeled and validated. In addition, its physicochemical properties, antigenicity, allergenicity, and virulence traits were evaluated. Molecular docking studies indicated strong interactions between the vaccine peptide and the TLR2 receptor. Furthermore, molecular dynamics simulations and immune simulation studies reflected its potent cytosolic stability and robust immune response dynamics induced by the vaccine. Conclusion: This study explored an innovative structure-guided approach in the use of immunoinformatics and reverse vaccinology in pursuit of a novel multi-epitope vaccine against the highly immunogenic monkeypox viral proteins. The simulation studies indicated the engineered vaccine candidate to be promising in providing prophylaxis to the monkeypox virus; nevertheless, further in vitro and in vivo investigations are required to prove its efficacy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,502
Score d'incertitude au seuil0,975

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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