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Enregistrement W4388943550 · doi:10.3389/fimmu.2023.1166059

Integrated antibody and cellular immunity monitoring are required for assessment of the long term protection that will be essential for effective next generation vaccine development

2023· article· en· W4388943550 sur OpenAlexaff
Eustache Paramithiotis, Christophe Varaklis, Stéphane Pillet, Shahin Shafiani, Mary Pat Lancelotta, Steven R. Steinhubl, Scott Sugden, Matt Clutter, Damien Montamat‐Sicotte, Todd Chermak, Stephanie Y. Crawford, Bruce L. Lambert, John Mattison, Robert L. Murphy

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Immunology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCAR-T cell therapy research
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunityImmune systemCellular immunityClinical trialImmunologyVaccine efficacyPandemicMedicineRisk analysis (engineering)Coronavirus disease 2019 (COVID-19)BiologyBioinformaticsDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The COVID pandemic exposed the critical role T cells play in initial immunity, the establishment and maintenance of long term protection, and of durable responsiveness against novel viral variants. A growing body of evidence indicates that adding measures of cellular immunity will fill an important knowledge gap in vaccine clinical trials, likely leading to improvements in the effectiveness of the next generation vaccines against current and emerging variants. In depth cellular immune monitoring in Phase II trials, particularly for high risk populations such as the elderly or immune compromised, should result in better understanding of the dynamics and requirements for establishing effective long term protection. Such analyses can result in cellular immunity correlates that can then be deployed in Phase III studies using appropriate, scalable technologies. Measures of cellular immunity are less established than antibodies as correlates of clinical immunity, and some misconceptions persist about cellular immune monitoring usefulness, cost, complexity, feasibility, and scalability. We outline the currently available cellular immunity assays, review their readiness for use in clinical trials, their logistical requirements, and the type of information each assay generates. The objective is to provide a reliable source of information that could be leveraged to develop a rational approach for comprehensive immune monitoring during vaccine development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,063

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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