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Enregistrement W4388945550 · doi:10.3389/frfst.2023.1239884

High-throughput screening of natural compounds for prophage induction in controlling pathogenic bacteria in food

2023· article· en· W4388945550 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Food Science and Technology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of GuelphMcGill University
Organismes subventionnairesGénome QuébecMcMaster UniversityGenome Canada
Mots-clésProphageBiologyEscherichia coliMicrobiologyContext (archaeology)BacteriaSOS responseChemistryFood scienceGeneticsGeneBacteriophage

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The clean label trend emphasizes the need for natural approaches to combat pathogenic bacteria in food. This study explores the potential of inducing prophages within bacterial genomes as a novel strategy to control pathogenic and spoilage bacterial growth. Methods: A luminescence-based high-throughput assay was developed to identify natural compounds capable of inducing prophages. Bioactive compounds from four chemical libraries were screened at a final concentration of 10 µM. The assay measured luminescence production in Escherichia coli BR513, a genetically modified strain producing β-galactosidase upon prophage λ induction. Luminescence values were normalized to cell concentration (OD600) and the interquartile mean of each 384-well plate. A cut-off for normalized luminescence values, set at 2.25 standard deviations above the mean, defined positive prophage induction. Results: Four naturally-derived compounds (osthol, roccellic acid, galanginee, and sclareol) exhibited positive prophage induction, along with previously identified inducers, rosemary, and gallic acid. Dose-response experiments were conducted to determine optimal concentrations for prophage induction. However, the results could not distinguish between prophage-induced cell death and other mechanisms, making it challenging to identify ideal concentrations. Discussion: The high-throughput luminescent prophage induction assay serves as a valuable tool for the initial screening of natural bioactive compounds that have the potential to enhance food safety and quality by inducing prophages. Further research is required to understand the mechanism of bacterial cell death and to establish optimal concentrations for prophage induction in a food preservation context.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil0,416

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle