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Enregistrement W4388948835 · doi:10.1016/j.isci.2023.108574

Global blood miRNA profiling unravels early signatures of immunogenicity of Ebola vaccine rVSVΔG-ZEBOV-GP

2023· article· en· W4388948835 sur OpenAlexaff
Eleonora Vianello, Josefine Persson, Björn Andersson, Suzanne van Veen, Thomaz Lüscher Dias, Francesco Santoro, Malin Östensson, Ogonna Obudulu, Christopher Agbajogu, Sara Torkzadeh, Sélidji Todagbé Agnandji, Rafi Ahmed, Jenna Anderson, Floriane Auderset, Philip Bejon, Luisa Borgianni, Jessica S. Brosnahan, Annalisa Ciabattini, Olivier Engler, Mariëlle C. Haks, Ali M. Harandi, Donald Gray Heppner, Alice Gerlini, Angela Huttner, Peter G. Kremsner, Donata Medaglini, Thomas P. Monath, Francis M. Ndungu, Patricia Njuguna, Tom H. M. Ottenhoff, David Pejoski, Mark Page, Gianni Pozzi, Claire‐Anne Siegrist, Sheri Dubey, Micheal J. Eichberg, Patrícia Gonzalez‐Dias, Paulin N. Essone, Lumeka Kabwende, Helder I. Nakaya, Sravya Sowdamini Nakka, Sylvia Rothenberger

Notice bibliographique

RevueiScience · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesInnovative Medicines InitiativeGöteborgs UniversitetChinese Academy of SciencesInnovative Health Initiative
Mots-clésImmunogenicityEbola vaccineEbola virusVirologyAntibodyVaccinationImmunologyBiologyEbolavirusmicroRNAImmune systemMedicineOutbreakGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The vectored Ebola vaccine rVSVΔG-ZEBOV-GP elicits protection against Ebola Virus Disease (EVD). In a study of forty-eight healthy adult volunteers who received either the rVSVΔG-ZEBOV-GP vaccine or placebo, we profiled intracellular microRNAs (miRNAs) from whole blood cells (WB) and circulating miRNAs from serum-derived extracellular vesicles (EV) at baseline and longitudinally following vaccination. Further, we identified early miRNA signatures associated with ZEBOV-specific IgG antibody responses at baseline and up to one year post-vaccination, and pinpointed target mRNA transcripts and pathways correlated to miRNAs whose expression was altered after vaccination by using systems biology approaches. Several miRNAs were differentially expressed (DE) and miRNA signatures predicted high or low IgG ZEBOV-specific antibody levels with high classification performance. The top miRNA discriminators were WB-miR-6810, EV-miR-7151-3p, and EV-miR-4426. An eight-miRNA antibody predictive signature was associated with immune-related target mRNAs and pathways. These findings provide valuable insights into early blood biomarkers associated with rVSVΔG-ZEBOV-GP vaccine-induced IgG antibody responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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