Epistemology of synthetic biology: a new theoretical framework based on its potential objects and objectives
Notice bibliographique
Résumé
Synthetic biology is a new research field which attempts to understand, modify, and create new biological entities by adopting a modular and systemic conception of the living organisms. The development of synthetic biology has generated a pluralism of different approaches, bringing together a set of heterogeneous practices and conceptualizations from various disciplines, which can lead to confusion within the synthetic biology community as well as with other biological disciplines. I present in this manuscript an epistemological analysis of synthetic biology in order to better define this new discipline in terms of objects of study and specific objectives. First, I present and analyze the principal research projects developed at the foundation of synthetic biology, in order to establish an overview of the practices in this new emerging discipline. Then, I analyze an important scientometric study on synthetic biology to complete this overview. Afterwards, considering this analysis, I suggest a three-level classification of the object of study for synthetic biology (which are different kinds of living entities that can be built in the laboratory), based on three successive criteria: structural hierarchy, structural origin, functional origin. Finally, I propose three successively linked objectives in which synthetic biology can contribute (where the achievement of one objective led to the development of the other): interdisciplinarity collaboration (between natural, artificial, and theoretical sciences), knowledge of natural living entities (past, present, future, and alternative), pragmatic definition of the concept of "living" (that can be used by biologists in different contexts). Considering this new theoretical framework, based on its potential objects and objectives, I take the position that synthetic biology has not only the potential to develop its own new approach (which includes methods, objects, and objectives), distinct from other subdisciplines in biology, but also the ability to develop new knowledge on living entities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,026 | 0,022 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,013 | 0,008 |
| Études des sciences et des technologies | 0,005 | 0,056 |
| Communication savante | 0,019 | 0,024 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,009 |
| Intégrité de la recherche | 0,006 | 0,007 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».