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Enregistrement W4389018792 · doi:10.1096/fasebj.31.1_supplement.772.5

Fluorescence Investigations of the Rate‐Limiting Step in the HCN Ion Channel Deactivation Pathway

2017· article· en· W4389018792 sur OpenAlexaff
Kaylee EA Magee, Tom W. Claydon, Edgar C. Young

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neural Engineering
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDepolarizationChemistryHCN channelBiophysicsHyperpolarization (physics)GatingMembrane potentialIon channelCoupling (piping)StereochemistryBiochemistryMaterials scienceBiologyNuclear magnetic resonance spectroscopy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hyperpolarization‐ and cyclic nucleotide‐activated (HCN) ion channels support electrical oscillations of neuronal networks and help prevent absence seizures. The S4 helix of the voltage‐sensor (VS) region in HCN channels moves inwards upon hyperpolarization and this movement is coupled to pore opening. An open HCN channel can further be stabilized by cAMP binding to its C‐terminal region. Modifying the speed of the rate‐limiting step for HCN channel gating might help treat neuropathies, but the steps in the gating pathway are unclear. Specifically, it has been proposed that the depolarization‐dependent deactivation pathway of HCN channels includes a voltage‐independent pore closure step that becomes rate‐limiting at strong depolarizations. To clarify which step is rate‐limiting at different depolarizations, we performed voltage clamp fluorometry on mouse HCN2 channel derivatives expressed in Xenopus oocytes using a fluorophore attached to the N‐terminal region of the S4 helix. These results represent the first direct measurement of VS movements of an HCN2 channel. The fluorophore tracked depolarization‐dependent VS movements during deactivation that preceded pore closure significantly at strong depolarizations; the current decay rate was approximately 4‐fold slower than the fluorescence decay rate at +20 mV. We call this ratio of decay rates the “transmembrane coupling quotient”. At weaker depolarizations, VS movements still preceded pore closure, but less dramatically (transmembrane coupling quotient approximately 1.5‐fold at ‐60 mV). This voltage dependence of the transmembrane coupling quotient was cAMP‐independent, i.e., it remained similar even when cAMP binding was prevented by a mutation in the C‐terminal region. The voltage dependence of the transmembrane coupling quotient is consistent with a model of mammalian HCN channel deactivation where the VS undergoes movements that have a greater voltage dependence compared to pore closure movements. VS movements may serve as the rate‐limiting step for deactivation at weak depolarizations, but another step – perhaps pore closure – is the rate‐limiting step at strong depolarizations. The temporal association between VS movements and pore movements would thus be loose at strong depolarizations, and tight at weak depolarizations. Support or Funding Information Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) Postgraduate Scholarship to K.E.A.M; Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) Discovery Grant to E.C.Y

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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