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Enregistrement W4389019048 · doi:10.1096/fasebj.31.1_supplement.763.2

Characterization of Anti‐SOD1 Antibodies and Detection of Intermediary SOD1 Oligomers

2017· article· en· W4389019048 sur OpenAlexaff
Ryan Saleh Atlasi, R. K. Malik, Christian Corrales, Laura Tzeplaeff, Neil R. Cashman, Gal Bitan

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of British Columbia Hospital
Organismes subventionnairesRGK Foundation
Mots-clésSOD1ChemistryAntibodyPolyclonal antibodiesThioflavinSuperoxide dismutaseBiochemistryEpitopeMolecular biologyEnzymeAlzheimer's diseaseBiologyImmunologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the gene encoding the enzyme copper‐zinc superoxide dismutase (SOD1) are linked to 10–20% of familial amyotrophic lateral sclerosis (fALS) cases. The mutations lead to misfolding and self‐assembly of SOD1 into toxic oligomers and aggregates, resulting in motor neuron degeneration. However, the molecular mechanisms underlying SOD1 aggregation and toxicity are unclear. Characterization and detection of SOD1 oligomers is particularly challenging due to their metastable nature. Antibodies against oligomeric and misfolded SOD1 forms are useful tools for this purpose, provided their specificity and selectivity are well characterized, which is not always the case. In this study, we set out to characterize three novel anti‐misfolded SOD1 antibodies and compare them with two commercial anti‐misfolded SOD1 antibodies raised against G93A SOD1. As controls, we compared the reactivity of these antibodies to two polyclonal anti‐SOD1 antibodies that were expected to be insensitive to misfolding. We asked whether the antibodies could distinguish among native and misfolded conformations of SOD1 and whether any of them were specific for the elusive oligomeric forms of the protein. To follow SOD1 conformational change and aggregation kinetics, wild‐type and G93A SOD1 were incubated under reducing conditions and the reactions were followed using thioflavin T (ThT) fluorescence, electron microscopy (EM), and dot blots with each antibody. Control reactions were followed under non‐reducing conditions. The three new anti‐misfolded SOD1 and one of the commercial antibodies (B8H10) showed maximum affinity at the time oligomers were expected to dominate and lost affinity with fibril formation. Unexpectedly, the two polyclonal antibodies also showed preference for oligomers, especially of G93A SOD1. Surprisingly, the other commercial anti‐misfolded SOD1 antibody, C4F6, showed specificity for G93A SOD1 regardless of misfolding. Two of the new antibodies showed preference for early or late oligomers, suggesting that they could expand currently detectable temporal resolution. In conclusion, our data indicate that certain antibodies are highly sensitive to the misfolded form of SOD1, whereas others are insensitive to either mutation or aggregation. Support or Funding Information RGK Foundation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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