MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4389019681 · doi:10.1096/fasebj.31.1_supplement.741.3

The <i>Klebsiella pneumoniae</i> Gene <i>ytfL</i> Triggers Microtubule Disassembly in Lung Epithelial Cells through KATNAL1

2017· article· en· W4389019681 sur OpenAlexafffund
Michael Dominic Chua, L. Kristopher Siu, Kuo‐Ming Yeh, Julian A. Guttman

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Health Research Institutes
Mots-clésMicrotubuleBiologyCell biologyKlebsiella pneumoniaeCytoskeletonGenePhenotypeCellMicrobiologyEscherichia coliGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Gram‐negative bacterium Klebsiella pneumoniae can cause septicemia, pneumonia, liver abscesses, and meningitis resulting in mortality rates as high as 44%. Unfortunately, the sub‐cellular interactions of these bacteria with host cells remain poorly understood. Because many bacterial pathogens target the host cell cytoskeleton, we examined the host cell cytoskeleton of K. pneumoniae ‐infected lung epithelial cells. In this study, we focused on the host microtubule network and found that microtubules were severed by the microbes, which ultimately led to the disassembly of the entire microtubule network. Because severing of microtubules in lung epithelial cells are regulated by host cell mechanisms, we hypothesized that a K. pneumoniae gene product would trigger the microtubule severing events through the activation of a host microtubule severing protein. To test this hypothesis, we screened the known disease‐causing proteins of K. pneumoniae and found that expression of the capsular polysaccharide, outer membrane porins, and the type VI secretion system were not important for inducing microtubule severing. Next, we constructed and screened a library encompassing essentially all (~3000) K. pneumoniae genes to identify genes that could cause this phenotype. Using this library, we identified the gene KP ytfL that caused the microtubule severing phenotype. To further characterize this novel mechanism, we immunolocalized all known epithelial cell microtubule severing proteins in K. pneumoniae ‐infected cells and found that the katanin‐like protein 1 (KATNAL1) localized precisely to the sites of microtubule severing. Taken together, our study shows that K. pneumoniae exploits a novel strategy to disassemble epithelial cell microtubules during its infections. The disassembly of microtubules is initiated by the expression of the bacterial gene KP ytfL , which ultimately induces the host protein KATNAL1 to sever microtubules and disrupt the microtubule network of host cells. Support or Funding Information This study was funded by NSERC, Taiwan NHRI and SFU Funds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetBacteriophages and microbial interactions→Travaux en français237 207→