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Enregistrement W4389019950 · doi:10.1096/fasebj.31.1_supplement.781.13

Investigation of a Role for AGPAT4 in Mouse Skeletal Muscle

2017· article· en· W4389019950 sur OpenAlexaffabout
Ryan M. Bradley, Darin Bloemberg, Andrew Mitchell, Val A. Fajardo, Juan J. Aristizabal Henao, Catherine A. Bellissimo, Emily B. Mardian, Marie‐France Paré, Éric Bombardier, Katherine A. Moes, A. Russell Tupling, Joe Quadrilatero, Ken D. Stark, Robin E. Duncan

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesEpidermolysis Bullosa Medical Research Foundation
Mots-clésPhosphatidic acidSkeletal muscleChemistryEndocrinologySoleus muscleInternal medicinePhosphatidylinositolPhospholipidBiologyBiochemistryCell biologySignal transductionMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Acylglycerophosphate acyltransferases (AGPATs) are a group of homologous proteins that function in the de novo synthesis and remodeling of glycerophospholipids, catalyzing the acyl‐CoA‐dependent acylation of lysophospholipids. We have recently determined that AGPAT4 is mitochondrial, and is a canonical AGPAT, preferentially utilizing lysophosphatidic acid as an acyl acceptor. However, we found that it functions in brain to regulate levels of phosphatidylinositol, phosphatidylcholine (PC), and phosphatdylethanolamine (PE), rather than phosphatidic acid per se . Whether this effect is tissue specific has not yet been investigated. The presence of multiple AGPATs suggests that different homologues may feed phosphatidic acid into unique phospholipid species synthesis pathways, although this remains poorly characterized. Phosphatidic acid (PA) metabolism is of particular interest in skeletal muscle, where levels of this phospholipid are involved in mediating muscle force contractility, muscle size, and initiation of mTOR signaling, among other effects. We have therefore investigated a role for AGPAT4 in skeletal muscle biology. We performed immunohistochemistry on AGPAT4 in cross sections from C57Bl/6J mouse soleus and extensor digitorum longus (EDL) muscle, and found that it is predominantly visualized in type IIa muscle fibres, as compared to type I, IIb, or IIx muscle fibres. We next investigated the impact of Agpat4 gene ablation on muscle physiology and function. Force contraction was significantly reduced in soleus muscle but not EDL from Agpat4 −/− mice, in agreement with the higher proportion of type IIa fibres in the former muscle type. Interestingly, however, our studies indicate no difference between Agpat4 −/− mice and wildtype littermates in measures of time to exhaustion during treadmill running tests. We found a significantly higher content of PA and PE in the soleus muscles of Agpat4 −/− mice, with no difference in TAG content. As well, there were no apparent differences in mitochondrial content or function, suggesting that mitochondrial function is not impaired by Agpat4 deficiency in skeletal muscle. This work is the first to characterize the role of a bona fide AGPAT in skeletal muscle function. Support or Funding Information This work was supported by grants to RED from the Canada Foundation for Innovation – Leader's Opportunity Fund and Ontario Research Fund (Project#30259), and a Discovery Grant (#418213‐2012) from the Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) of Canada. RMB, JJAH, DB are supported by an NSERC PGS‐D, VAF was supported by a CIHR Doctoral Scholarship, ASM was supported by an NSERC CGS‐D award, EBM was supported by an PGS‐M scholarship.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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