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Enregistrement W4389020697 · doi:10.1096/fasebj.31.1_supplement.955.13

Palmitic and Stearic Free Fatty Acids Are Consistently Found in Materials used for Dried Blood Spot Collection

2017· article· en· W4389020697 sur OpenAlexaffabout
Jan Gunash, Juan J. Aristizabal Henao, Ken D. Stark

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBiosimilars and Bioanalytical Methods
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChromatographyChemistryFormic acidFatty acidStearic acidDried blood spotPalmitic acidBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Dried blood spotting has been used to collect samples for fatty acid analysis, particularly when access to analytical laboratories or ultra‐cold storage is limited. However, the materials used to collect dried blood spots are often contaminated with lipids and/or fatty acids. Objective To measure background/containment fatty acid and lipids on materials used to collect dried blood spots. Methods Three materials used for dried blood spot collection that included 903 protein saver cards (Fischer Scientific, St. Louis, USA), chromatography paper cut into strips (Analtech Inc., Newark, DE), and novel Mitra Microsamplers (Neoteryx, California, USA). Blank collection materials as purchased were handled with nitrile gloves and preexisting lipids were extracted using 2:1 chloroform:methanol (v/v) solution. Lipid extracts were divided into two, with one portion for gas chromatography (GC) analysis of fatty acids and the other portion for lipidomic analyses using ultra‐high performance liquid chromatography coupled with tandem mass spectrometry (UHPLC‐MS/MS) in a quadrupole‐orbitrap system (Q‐Exactive, Thermo Scientific, New York, USA). Fatty acid methyl esters were prepared for GC analysis by direct transesterification of the lipid extracts using boron trifluoride. Lipid extracts were dried and re‐suspended in 65:35:5 acetonitrile:isopropanol:water + 0.1% formic acid and analyzed using a 47‐minute reversed‐phase UHPLC multi‐step binary protocol with top‐5 data dependent MS/MS acquisition. Samples were run twice, once under positive ESI‐MS/MS and once under negative ESI‐MS/MS to enable the identification of compounds that preferentially ionize with different polarities. Results GC analysis identified 0.64±0.05 μg of palmitic acid (C16:0) and 0.88±0.04 μg stearic acid (C18:0) per 6mm punch from 903 protein saver cards, 0.97±0.08 μg 16:0 and 1.43±0.16 μg 18:0 per 6mm punch of Whatman chromatography paper and 0.64±0.08 μg 16:0 and 0.88±0.10 μg 18:0 per Mitra tip. In the positive ESI‐MS/MS analyses, scanning for fragment losses of phospholipids (choline, ethanolamine, serine head groups) did not result in extracted ion chromatograms that would indicate that these compounds were present. Neutral‐loss scanning of fatty acids like palmitate and stearate in positive ESI also showed no evidence of other complex lipids such as triacylglycerols or cholesteryl esters in the blank samples. However, negative ESI‐MS/MS experiments confirmed that the palmitate and stearate that were identified using GC are found as free fatty acids and not as part of complex lipids. Conclusions Materials used to collect dried blood spots appear consistently contaminated with palmitic and stearic free fatty acids. GC determinations of fatty acids from dried blood spots samples need to consider this contamination and/or take steps to prewash sample collecting materials. For lipidomic analysis, these contaminants can be ignored if complex lipids and not free fatty acids are being examined. Support or Funding Information This work was supported by a Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) Discovery grant (327149, to K.D.S), and an NSERC doctoral scholarship to J.J.A.H. K.D.S. is also supported by a Canada Research Chair in Nutritional Lipidomics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,190
Score d'incertitude au seuil0,727

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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