Functional Significance of Intermediate Cleavages in the 5′ETS of <i>Schizosaccharomyces pombe</i> pre‐rRNA
Notice bibliographique
Résumé
The biosynthesis and incorporation of mature ribosomal RNAs (18S, 5.8S and 25S rRNA) into ribosomes is dependent on coordinated and interdependent processing events, acting as a “quality control mechanism”. Transcribed spacers are critical to processing and act as “biological springs” to enable the appropriate configuration of maturing termini. The pre‐rRNA 5′ external transcribed spacer (5′ ETS) of Schizosaccharomyces pombe contains structural elements critical for initiation and efficient pre‐rRNA processing. Examination of termini in the 5′ ETS region based on ligation‐mediated RT‐PCR revealed two major intermediate cleavage sites (A1 and A2) in addition to the A0 cleavage, which forms the mature 5′ end of the 18S rRNA. Mutational analyses at the A2 intermediate cleavage site indicate that this cleavage is not critical to rRNA maturation and can be eliminated. Mapping of the 5′ ETS region in cells with temperature sensitive nucleases, using RT‐PCR, refute formation of the mature 5′ end of 18S rRNA by RNase III‐like endonucleolytic cleavage across an extended hairpin. Mutational analysis around the 5′ ETS/18S rRNA junction indicate cleavage is not dependent on sequence and/or structure, but can dramatically affect rRNA yield. Additionally, mutations in U3 snoRNA or a complementary site in the 5′ 18S rRNA pseudoknot can significantly affect the 18S/25S rRNA ratio. These results raise the possibility that the 5′ end of the 18S rRNA is the result of ribozyme cleavage and that the U3 snoRNA acts as a chaperone to stabilize RNA structure. Support or Funding Information Supported by the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».