The B domain of the mitochondrial fission mechanoenzyme Drp1 is intrinsically disordered and coacervates under crowding conditions
Notice bibliographique
Résumé
The Dynamin superfamily is a class of large GTPases that perform essential membrane remodeling events via self‐assembly stimulated GTP hydrolysis in a manner that involves the coordination of lipid‐membrane interaction, high‐order oligomerization, and GTP hydrolysis, however a clear understanding of how these functions are coordinated has remained elusive. A “variable domain” (VD) is present in many superfamily members and may enable specific targeting to sites of action, but the nature of VD function is unclear in most dynamins. Dynamin‐related protein 1 (Drp1) is the primary mechanoenzyme responsible for mitochondrial fission. We seek to identify the role of the Drp1 VD, or B domain. We find that removal of the B domain from Drp1 results in enhanced assembly and GTP hydrolysis, suggesting that the B domain has an auto‐inhibitory role. We find that the B domain is intrinsically disordered (ID) and surprisingly, undergoes phase separation or coacervation under conditions that induce other ID proteins to fold. The same conditions that induce phase separation of the B domain also enhance binding to cardiolipin, a lipid that is unique to the mitochondrial membrane. Based on these findings we suggest a model in which the B domain inhibit Drp1 assembly by dynamically occluding assembly interfaces, and that this auto‐inhibition is relieved upon interaction of the B domain with cardiolipin at the mitochondrial membrane, involving the process of coacervation. This model may also be applicable to other members of the dynamin superfamily, and intrinsically disordered membrane remodeling proteins in general. Support or Funding Information NIH R01‐GM067180
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».