MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4389023316 · doi:10.1096/fasebj.31.1_supplement.1083.16

Knockdown of Tim23 <i>In‐Vivo</i> Results in the Activation of the Mitochondrial Unfolded Protein Response

2017· article· en· W4389023316 sur OpenAlexaffabout
Ashley N. Oliveira, David A. Hood

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteostasisUnfolded protein responseGene knockdownCell biologyMitochondrionBiologyInner mitochondrial membraneActivator (genetics)ChemistryEndoplasmic reticulumBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondria rely heavily on the tight coordination of the nuclear and mitochondrial genomes. Disruption of this regulation has been shown in lower order organisms to result in a mito‐nuclear imbalance in which holenzymes are unable to assume mature stoichiometry. This lack of coordination between nuclear and mitochondrially encoded subunits resulting in orphaned subunits is an activator of the mitochondrial unfolded protein response (UPR mt ). The UPR mt is a highly conserved quality control mechanism that strives to achieve proteostasis by refolding or degrading misfolded proteins as well as misassembled complexes. This process is well characterized in c. elegans however, the UPR mt and its retrograde signals are poorly understood in mammals. Thus we sought to induce the UPR mt in‐vivo‐ in a mammalian model to better characterize this stress response. In order to do so, C57BL/6 mice were injected once a day for 3 days with an antisense oligonucleotide (In‐Vivo Morpholino) targeted to Tim23, the major channel of the inner membrane, to perturb the genomic coordination. Following Tim23 Morpholino treatment, Tim23 protein content was significantly reduced by 50%. The consequence was a 60% reduction of protein import into the mitochondrial matrix. As a result, mitochondrial chaperone cpn10 was significantly elevated by 30% and the transcription factor ATF5 also demonstrated a strong trend to increase, suggesting that the UPR mt was activated following Tim23 knockdown. Mitochondrial respiration and ROS emission was also measured to determine whether Tim23 knockdown resulted in mitochondrial dysfunction. However, no differences were found suggesting that the stress imposed is sufficient to induce the UPR mt without disrupting basic mitochondrial functions. The second aim of this study was to investigate the role of mitochondrial proteolytic byproducts in mediating retrograde signaling. Peptides released from the mitochondria following basal proteolysis were isolated and incubated with import reactions. Our results demonstrate a dose‐ and time‐dependent inhibition of import with the addition of peptides, such that import was reduced by 48% with the addition of 6ug of peptides for 30 minutes. This suggests that mitochondrial proteolytic byproducts can exert an inhibitory effect on the protein import pathway, to inhibit excessive protein import as a negative feedback mechanism. The inhibition of import into the organelle may also serve a retrograde function, to modify nuclear gene expression and improve organelle folding capacity, or alter the expression of protein import machinery components. Support or Funding Information This work is supported by the Natural Science and Engineering Research Council (NSERC) of Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetMitochondrial Function and Pathology→Travaux en français237 207→