Exploring GTP Control of Bacterial Respiratory System Specific Chaperone Interaction with its Substrate Protein's Twin‐Arginine Signal Peptide
Notice bibliographique
Résumé
Many bacterial respiratory redox enzymes depend on the twin‐arginine translocase (Tat) system for translocation and/or membrane insertion. Tat substrates contain an N‐terminal twin‐arginine (SRRxFLK) motif serving as the targeting signal towards the translocon. Many Tat substrates have a system specific chaperone ‐ redox enzyme maturation protein (REMP) – to help mediate final folding and assembly prior to Tat binding. The REMP DmsD strongly interacts with the twin‐arginine motif of the DmsA signal sequence of dimethyl sulfoxide (DMSO) reductase (DmsABC). DmsD adopts monomer, dimer, and unique folding forms that appear under pH control. All alternate DmsD forms retain the ability to bind DmsAL. As well, it is now suggested that DmsD cooperatively binds guanosine‐5′‐triphosphate (GTP), which elicits a dissociative effect on the DmsD to DmsAL interaction. Thus, the primary aim of this study was to analyze DmsD thermal stability when subjected to both GTP association and variance in pH. We have utilized two in vitro protein‐protein interaction techniques of an affinity pull down assay, as well as protein thermal stability measurement via differential scanning fluorimetry (DSF). DSF experiments, yielding melting temperatures as a determinant of the associated thermal stability, showed an increase in DmsD stabilization upon DmsAL binding. Between pH values of 5.0 and 6.0, DmsD demonstrated the least amount of DmsAL release. This pH range also corresponds to a transition in DmsD folding forms. When DmsD was first subjected to GTP binding, subsequent variance in pH decreased melting cooperativity by the appearance of a pretransition peak, but did not affect melting temperature. However, if alteration in pH occurred prior to GTP binding, the pretransition peak was attenuated, and an incremental increase in melting temperature was observed. These findings illustrate that a greater affinity for DmsAL promotes an increase in DmsD thermal stability. As well, pH shift results in formation of a more uniform DmsD population, with subsequent GTP binding permitting an increase in thermal stability. These results support the idea that H + and GTP play roles as molecular regulators in the biochemical pathway of DmsAB protein maturation – Tat system targeting mechanism. Support or Funding Information Research was supported by a Canadian Institutes of Health Research operating grant ( MOP‐49422 ) to RJT.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».